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專注多肽 服務(wù)科研
我們的研究重點(diǎn)是膜蛋白的結(jié)構(gòu)表征和從頭蛋白質(zhì)設(shè)計(jì),以了解與人類疾病相關(guān)的生物過(guò)程并開發(fā)新的治療方法。 蛋白質(zhì)設(shè)計(jì):我們使用從頭蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)來(lái)測(cè)試我們的知識(shí)是否已經(jīng)足夠先進(jìn),可以根據(jù)第一原理生成結(jié)構(gòu)和功能。我們的實(shí)驗(yàn)室還使用這種方法將所需的功能整合到生物系統(tǒng)中。 整合素抑制劑:我們研究整合素中信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和構(gòu)象變化的機(jī)制,并設(shè)計(jì)了特定整合素的新型小分子抑制劑,用作組織纖維化和其他疾病的治療劑。 流感:我們研究甲型流感的基質(zhì) 2 蛋白 (M2),它是在流感病毒包膜中發(fā)現(xiàn)的藥物靶標(biāo)。 阿爾茨海默?。何覀儗?duì)結(jié)構(gòu)表征和破壞與阿爾茨海默病相關(guān)的 Aβ 積累感興趣。 細(xì)菌感知:我們對(duì)細(xì)菌感知環(huán)境和適應(yīng)不同環(huán)境壓力的機(jī)制感興趣。 計(jì)算工具:我們采用了一種受自然啟發(fā)的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)方法。
CCMS 開創(chuàng)的光譜網(wǎng)絡(luò)范式在三個(gè)基本方面不同于解釋串聯(lián)質(zhì)譜的主流范式。首先,光譜網(wǎng)絡(luò)基于將光譜與其他光譜而不是與蛋白質(zhì)序列進(jìn)行匹配。其次,光譜網(wǎng)絡(luò)甚至在考慮可能的識(shí)別之前就從相關(guān)肽(例如,修飾/未修飾或重疊序列變體)中找到光譜。第三,光譜網(wǎng)絡(luò)確定來(lái)自相關(guān)肽的光譜組的一致識(shí)別,而不是單獨(dú)嘗試一次識(shí)別每個(gè)光譜。
滲透性分析開發(fā) 大多數(shù)膜通透性測(cè)定是在基于細(xì)胞的系統(tǒng)(如 CACO-2)或非膜無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)(如 PAMPA)中進(jìn)行的。我們正在開發(fā)一種基于脂質(zhì)體的滲透性系統(tǒng),旨在反映生理上準(zhǔn)確的磷脂雙層中的被動(dòng)滲透性。 固相合成方法 我們正在開發(fā)構(gòu)建環(huán)狀肽的新方法,其靈感來(lái)自于天然產(chǎn)物,例如環(huán)孢菌素 A、destruxins 和 aureobasidin E。這些環(huán)狀肽中的許多都包含主鏈修飾,例如 N-甲基化和內(nèi)酯 (depsi) 鍵,用于增加它們的結(jié)構(gòu)多樣性并增強(qiáng)膜通透性和代謝穩(wěn)定性。我們對(duì)新的合成方法感興趣,這些方法有助于合成含有這些非蛋白氨基酸和連接的環(huán)狀肽的天然產(chǎn)物樣文庫(kù)。 環(huán)肽文庫(kù) 我們正在使用面向多樣性的合成技術(shù)來(lái)生成受天然產(chǎn)物啟發(fā)的大型環(huán)狀肽庫(kù)。我們正在使用從模型系統(tǒng)研究中學(xué)到的原則,使圖書館成員偏向于膜通透性和代謝穩(wěn)定性。 抑制蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用
環(huán)肽、訂書肽和支鏈肽是一類具有良好治療特性的生物分子。訂書肽和環(huán)肽是非線性肽,在生理環(huán)境中顯示出生物穩(wěn)定性和對(duì)蛋白水解消化的抵抗力。防止降解的肽已顯示出高效力和低毒性。因此,環(huán)肽、訂書肽有著很好的用于治療的前景。
對(duì)于分子生物學(xué)來(lái)講,生物分析手段的發(fā)展,是闡明機(jī)理的必要條件。在研究分子間相互作用的道路上,人們不斷探索,總結(jié)出很多方法,免疫技術(shù),晶體衍射,核磁共振等。1948年,熒光共振能量轉(zhuǎn)移(Fluorescence resonance energy transfer,F(xiàn)RET)理論被首次提出,它可以測(cè)定1.0-6.0nm距離內(nèi)分子間的相互作用。1967年,這一理論得到了實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,將1.0-6.0nm的距離稱為光學(xué)尺。二十世紀(jì)八十年代出,通過(guò)科學(xué)家的不斷探索,F(xiàn)ret技術(shù)成功運(yùn)用到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的研究中。自Fret熒光共振能量技術(shù)誕生以來(lái),已結(jié)合多種先進(jìn)的技術(shù)和方法,如電子顯微鏡,X射線衍射等,推動(dòng)了分子生物學(xué)檢測(cè)手段的發(fā)展。
熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)是一種非輻射能量躍遷,通過(guò)分子間的電偶極相互作用,將供體激發(fā)態(tài)能量轉(zhuǎn)移到受體激發(fā)態(tài)的過(guò)程。此過(guò)程沒(méi)有光子的參與,所以是非輻射的。該分析方法具有快速、敏感和簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn)。
細(xì)胞穿透肽 (CPP) 越來(lái)越多地用于原核細(xì)胞和真核細(xì)胞中的細(xì)胞藥物遞送,寡聚精氨酸引起了廣泛關(guān)注。富含精氨酸的 CPP 如何跨細(xì)胞膜易位,特別是對(duì)于原核生物,仍然未知。富含精氨酸的 CPP 可有效地將抗菌肽核酸 (PNA) 遞送至細(xì)菌中的細(xì)胞內(nèi) mRNA 靶標(biāo)。
在過(guò)去幾年中,出現(xiàn)了通過(guò)位點(diǎn)選擇性修飾使肽和蛋白質(zhì)功能化的手段。雖然這些方法中的大多數(shù)利用雜原子的固有親核性或脫氫丙氨酸的共軛加成,但極性逆轉(zhuǎn)尚未得到廣泛的研究。 近期,美國(guó)科羅拉多大學(xué)化學(xué)系一研究團(tuán)隊(duì)就介紹了能夠參與多種C-C, C-S和C-Se成鍵反應(yīng)的氨基碳酸鹽的AlaM umpolung試劑。為了證明這種強(qiáng)大的方法,該研究團(tuán)隊(duì)優(yōu)化了分子間和分子內(nèi)的交叉偶聯(lián),并將這些方案應(yīng)用于寡肽底物。同時(shí),該項(xiàng)研究強(qiáng)調(diào),AlaM試劑與水條件兼容,并在室溫下操作,不影響化學(xué)選擇性和產(chǎn)率。 此項(xiàng)研究以“Organometallic AlaM reagents for umpolung peptide diversification”為題發(fā)布在Chem Catalysis。該篇綜述描述了一個(gè)從已知的肽功能化策略出發(fā)的概念,并為將來(lái)獲得具有新拓?fù)涞碾幕Y(jié)構(gòu)的工作奠定了基礎(chǔ)。