說到三氟乙酸，它可是在多肽的合成、純化和檢測過程中，發(fā)揮著重要作用。接下來小編將從這三個方面進行講解，估計你就會明白為什么購買的多肽是三氟乙酸鹽了。

多肽的合成階段

在多肽合成的鏈增長階段（縮合與脫保護），沒有使用到三氟乙酸，不過通常在最后一步（切割步驟）使用到高濃度的三氟乙酸，以去除所有的側(cè)鏈保護基團。

這里是第一次使用到了三氟乙酸，我們拿到了粗品里面肯定是含有一定比例三氟乙酸這種物質(zhì)，后期沒有去除的話，那么多肽里面就會含有三氟乙酸。

多肽的純化階段

現(xiàn)在比較常規(guī)的多肽純化方法是 高效液相色譜制備方法（HPLC），其效率非常高，并能分離多肽雜質(zhì)，獲取目標結(jié)構(gòu)的多肽。

通常我們在使用HPLC制備多肽時，使用的A、B流動相（也叫有機相、水相）都添加了0.1%三氟乙酸，例如A流動相為0.1%TFA/H2O，B流動相為0.1%TFA/ACN

這里時第二次使用到了三氟乙酸，也是為什么多肽是三氟乙酸鹽的直接原因。用HPLC純化多肽后，我們收集到了目標峰的溶液，其中大部分水，小部分是乙腈（ACN），當然還有0.1%的TFA。

多肽的凍干階段

我們拿到上述HPLC制備后的多肽溶液，先用液氮或者-80攝氏度冰箱，將溶液的溫度降至最低，然后放到凍干機上，最后我們就拿到了蓬松的粉末狀固體的多肽啦。這是我們來分析下此時的多肽的主要成分。

從溶液到粉末狀固體的過程中，我們?nèi)サ袅藥缀跛械乃鸵译妫罱K會殘留
一些水份（通常在2%以內(nèi)）、
乙腈（因為乙腈很容易凍干揮發(fā)，殘留量極少）
三氟乙酸（三氟乙酸分子容易和肽段結(jié)構(gòu)中的堿性基團結(jié)合，其比例主要取決于肽段堿性基團的個數(shù)和純化的工藝，是一個未知數(shù)，這里是多肽是三氟乙酸的根本原因）

其它未分離開的雜質(zhì)多肽分子（這個可以通過HPLC純度來判斷）

現(xiàn)在我們來總結(jié)下，多肽是用高濃度三氟乙酸切割，去掉保護基團，并用含0.1%三氟乙酸的流動相來純化，最后凍干還會殘留三氟乙酸。所以通常情況下，我們購買的多肽就是三氟乙酸鹽的。

一般三氟乙酸鹽的多肽不適合做細胞實驗，畢竟三氟乙酸分子對細胞是有一定傷害的。不過不用擔心，在多肽純化階段，我們可以再次純化多肽，用醋酸或者鹽酸 置換掉 三氟乙酸，可以大幅度減少三氟乙酸的殘留量。以滿足實驗需求。