FITC(異硫氰酸熒光素酯)是多肽，抗體蛋白常用的熒光標(biāo)記物（入射波長(zhǎng)492nm，發(fā)射波長(zhǎng)518nm），一般修飾在多肽的N端或者序列中賴氨酸的側(cè)鏈上，在我們固相合成過(guò)的FITC修飾肽中，只要出現(xiàn)在序列N端的，我們?cè)谛揎桭ITC之前都會(huì)插入一個(gè)Linker，而在序列賴氨酸側(cè)鏈修飾的時(shí)候，往往都不需要插入linker，下面我們通過(guò)圖文介紹下這其中的原因。

Edman 降解(Edman degradation)，從多肽鏈游離的N末端測(cè)定氨基酸殘基的序列的過(guò)程。N末端氨基酸殘基被異硫氰酸苯酯修飾，然后從多肽鏈上切下修飾的殘基（此殘基就是直接與PITC相連接的氨基酸），再經(jīng)層析鑒定，余下的多肽鏈(少了一個(gè)殘基)被回收再進(jìn)行下一輪降解循環(huán)。

所以如果FITC直接修飾在N端氨基的時(shí)候，在切割過(guò)程中時(shí)候發(fā)生Edman degradation反應(yīng)，如下圖。

為了避免這個(gè)副反應(yīng)的發(fā)生，我們?cè)贜端標(biāo)記的時(shí)候一定要加一個(gè)linke，如2-氨基乙酸，3-氨基丙酸，6-氨基己酸，目前我們常用的是6-氨基己酸，應(yīng)為較長(zhǎng)的碳鏈可以降低對(duì)活性中心的影響，同時(shí)又能很好的與FITC反應(yīng)。所以賴氨酸側(cè)鏈修飾FITC，我們可以不用加linker。

例如有一個(gè)肽段序列為 FSGDCK，三字母為Phe-Ser-Gly-Asp-Cys-Lys

在N端標(biāo)記FITC，選用最常用的6-氨基己酸為L(zhǎng)inker，其結(jié)構(gòu)為

在C端K的側(cè)鏈標(biāo)記FITC，可以選擇不添加Linker,其結(jié)構(gòu)為

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