多肽SVMVDIDYNMQKRAK的參數(shù)和合成路線|三字母為Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|專(zhuān)肽生物產(chǎn)品-定制多肽合成服務(wù)

文章目錄

一、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的結(jié)構(gòu)圖

二、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的多肽參數(shù)

三、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的靜電荷圖

四、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的親疏水比例統(tǒng)計(jì)（條形圖）

五、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)（扇形圖）

六、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys|SVMVDIDYNMQKRAK的合成步驟

專(zhuān)肽生物官網(wǎng)：http://tsjxdd.com   （以下圖片均由專(zhuān)肽生物多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器自動(dòng)生成）

一、Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys的結(jié)構(gòu)圖如下

二、Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys的多肽參數(shù)如下

單字母：H2N-SVMVDIDYNMQKRAK-OH

三字母：H2N-Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys-COOH

中文序列：絲氨酸-纈氨酸-甲硫氨酸-纈氨酸-天冬氨酸-異亮氨酸-天冬氨酸-酪氨酸-天冬酰胺-甲硫氨酸-谷氨酰胺-賴氨酸-精氨酸-丙氨酸-賴氨酸

氨基酸個(gè)數(shù)：15

分子式：C76H128N22O24S2

平均分子量：1798.09

精確分子量(Exact Mass)：1796.89

等電點(diǎn)(PI)：10.25

pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù)：1.98

GRAVY值：-0.63

親水殘基比例：0.12

消光系數(shù)：1490

平均親水性及多肽溶解建議：親水（該多肽在純水中溶解性較好，大多數(shù)情況下無(wú)需助溶）

三、H2N-SVMVDIDYNMQKRAK-OH的靜電荷圖

四、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys的親疏水比例統(tǒng)計(jì)（條形圖）

五、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)（扇形圖）

六、多肽Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys的合成步驟：

1、合成CTC樹(shù)脂：稱取0.3g CTC Resin（如初始取代度約為1.0mmol/g）和0.4 mmol的Fmoc-Lys(Boc)-OH于反應(yīng)器中，加入適量DCM溶解氨基酸（需要注意，此時(shí)CTC樹(shù)脂體積會(huì)增大好幾倍，避免DCM溶液過(guò)少），再加入樹(shù)脂0.9 mmol的DIPEA((Mw：129.1,d：0.740g/ml))，反應(yīng)2-3小時(shí)后，可不抽濾溶液，直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇，封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次，甲醇洗滌1次，DCM洗滌一次，甲醇洗滌一次，DCM洗滌一次，DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌，是為了更好地去除其他溶質(zhì)，有利于后續(xù)反應(yīng))。得到Fmoc-Lys(Boc)-CTC Resin備用。結(jié)構(gòu)圖如下：

2、脫Fmoc：加3倍樹(shù)脂體積的20%Pip/DMF溶液，鼓氮?dú)?0分鐘，然后2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Lys(Boc)-CTC Resin。（此步驟脫除Fmoc基團(tuán)，茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色）。結(jié)構(gòu)圖如下：

3、縮合：取2.7mmol Fmoc-Ala-OH 氨基酸,加入到上述樹(shù)脂里，加適當(dāng)DMF溶解氨基酸，再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后，用2倍樹(shù)脂體積的DMF 洗滌3次樹(shù)脂。（洗滌樹(shù)脂，去掉殘留溶劑，為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備）。得到Fmoc-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin。氨基酸：DIPEA：HBTU：樹(shù)脂=3：6：2.85：1（摩爾比）。結(jié)構(gòu)圖如下：

4、依次循環(huán)步驟二、步驟三，依次得到

H2N-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Val-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

H2N-Val-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

Fmoc-Ser(tBu)-Val-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin

最后再經(jīng)過(guò)步驟二得到 H2N-Ser(tBu)-Val-Met-Val-Asp(OtBu)-Ile-Asp(OtBu)-Tyr(tBu)-Asn(Trt)-Met-Gln(Trt)-Lys(Boc)-Arg(Pbf)-Ala-Lys(Boc)-CTC Resin，結(jié)構(gòu)圖如下：

5、切割：6倍樹(shù)脂體積的切割液（或每1g樹(shù)脂加8ml左右的切割液），搖床搖晃 2小時(shí)，過(guò)濾掉樹(shù)脂，用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液，并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次，最后將沉淀物放真空干燥釜中，常溫干燥24小試，得到粗品 Ser-Val-Met-Val-Asp-Ile-Asp-Tyr-Asn-Met-Gln-Lys-Arg-Ala-Lys。

切割液選擇：1）TFA：H2O=95%：5%、TFA：H2O=97.5%：2.5%

2）TFA：H2O：TIS=95%：2.5%：2.5%

3）三氟乙酸：茴香硫醚：1，2-乙二硫醇：苯酚：水=87.5%：5%：2.5%：2.5%：2.5%

（前兩種適合沒(méi)有容易氧化的氨基酸，例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。）

6、純化凍干：使用液相色譜純化，收集目標(biāo)峰液體，進(jìn)行凍干，獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過(guò)這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。

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