Fmoc化學是由Eric Atherton和Bob Sheppard在1970年代后期在劍橋大學分子生物學實驗室開發(fā)的，并經(jīng)過Chan和White的審查（《 Fmoc固相肽合成–一種實用方法》，牛津大學出版社，2000年）。

在Fmoc固相肽合成中，肽鏈逐步連接，一次連接一個氨基酸，同時連接至不溶性樹脂載體。這允許在每個步驟通過簡單的洗滌除去反應副產(chǎn)物。氨基酸在其氨基末端被Fmoc（9-芴基甲氧基羰基）基團保護，并在羧酸末端活化后與生長鏈偶聯(lián)。然后通過哌啶處理除去Fmoc基團并重復該過程。肽組裝完成后，可通過用三氟乙酸（TFA）處理將其從樹脂上除去。同時，氨基酸側鏈上的保護基也被除去，得到粗線性肽。通過反相HPLC一步純化通常足以獲得純度> 95％的肽。

Fmoc合成反應溫和，靈活且用途廣泛，因此比替代Boc化學方法提供了更多的合成選擇。例如，TFA在裂解過程中僅使用一次，而在Boc過程中，每個周期都使用它。