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專(zhuān)注多肽 服務(wù)科研
多肽的兩端假如不封端的話,就會(huì)攜帶游離的氨基(N端)和游離的羧基(C端),而多肽的序列往往代表了母本蛋白的序列,為了與母本蛋白更為接近,多肽的兩端往往需要封閉,即N端乙酰化和C端酰胺化,這些修飾會(huì)減少多肽的總電荷,降低多肽的溶解度,也可以使多肽模擬它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始狀態(tài)。
下面,我們用多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器 來(lái)展示下多肽N端乙?;投嚯腃端酰胺化。
例如我們隨便給個(gè)序列RGDRGD,這種寫(xiě)法,代表左邊N端是氨基形式,右邊C端是羧基形式
輸入到多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器中,得到下圖
左邊的氨基H2N 具有正電荷,右邊的羧基COOH 具有負(fù)電荷。其水溶解性相對(duì)封端之后的 要好很多。
那么假如RGDRGD 進(jìn)行N端乙酰化和C端酰胺化之后,會(huì)是怎樣子的?
序列寫(xiě)法有很多種,例如Ac-RGDRGD-NH2;
Ac可以替換為Acetyl、乙?;cetylated、Acetylation等
NH2可以替換為 CONH2、酰胺化、amide等
輸入到多肽結(jié)構(gòu)圖計(jì)算器中,得到下圖
此時(shí)多肽的兩端沒(méi)有電荷了,更像它在母本蛋白中α氨基和羧基的原始狀態(tài),不過(guò)多肽的水溶解度降低了。
溫馨提示:您在文獻(xiàn)中查閱多肽序列時(shí),需要注意下多肽的兩端是否有封端的說(shuō)明。