多肽FINNWEFC的參數(shù)和合成路線|三字母為Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|專肽生物產(chǎn)品-定制多肽合成服務(wù)
文章目錄
一、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的結(jié)構(gòu)圖
二、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的多肽參數(shù)
三、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的靜電荷圖
四、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys|FINNWEFC的合成步驟
專肽生物官網(wǎng):http://tsjxdd.com (以下圖片均由專肽生物多肽結(jié)構(gòu)計算器自動生成)
一、Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys的結(jié)構(gòu)圖如下
二、Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys的多肽參數(shù)如下
單字母:H2N-FINNWEFC-OH
三字母:H2N-Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys-COOH
中文序列:苯丙氨酸-異亮氨酸-天冬酰胺-天冬酰胺-色氨酸-谷氨酸-苯丙氨酸-半胱氨酸
氨基酸個數(shù):8
分子式:C51H65N11O13S1
平均分子量:1072.19
精確分子量(Exact Mass):1071.45
等電點(PI):6.24
pH=7.0時的凈電荷數(shù):-0.05
GRAVY值:0.15
親水殘基比例:-
消光系數(shù):5500
平均親水性及多肽溶解建議:疏水(該多肽在水中的溶解性一般,可選擇以下方式助溶: 1、調(diào)整溶液的PH助溶(含Cys等氨基酸盡量不調(diào)為堿性) 2、超聲助溶(含Cys、Ser等氨基酸需減少超聲時間) 3、加熱助溶(溶液溫度≤30℃) 4、添加助溶劑(如DMSO,DMF等,建議遵循先有機溶液后無機溶液的原則)。 5、對于堿性肽,建議用10%乙酸溶解,對于酸性肽,建議用5-10%氨水溶解。
三、H2N-FINNWEFC-OH的靜電荷圖
四、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.3g CTC Resin(如初始取代度約為1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Cys(Trt)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入樹脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到Fmoc-Cys(Trt)-CTC Resin備用。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Cys(Trt)-CTC Resin。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取2.7mmol Fmoc-Phe-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準備)。得到Fmoc-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ile-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
H2N-Ile-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Ile-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Phe-Ile-Asn(Trt)-Asn(Trt)-Trp(Boc)-Glu(OtBu)-Phe-Cys(Trt)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)圖如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品 Phe-Ile-Asn-Asn-Trp-Glu-Phe-Cys。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復測下純度 是否目標純度。
七、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)公司定制多肽合成業(yè)務(wù):熒光標記肽(Cy3、Cy5、Cy5.5、Cy7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),同位素標記(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(p-Ser、p-Thr、p-Tyr),環(huán)肽(酰胺環(huán)、一對或多對二硫鍵環(huán)及定點成環(huán)),生物素標記肽(BIOTIN),復合抗原肽(MAP4、MAP8、MAP16),螯合劑(HYNIC),小分子化合物,PEG修飾,熒光淬滅基團標記(EDANS、DABCYL),甲基化修飾(Lys、Arg),光敏劑修飾,DOTA,NOTA,DOPA,疊氮修飾,兩支不同序列的分支肽,兩條不同序列多肽之間的多對二硫鍵等。
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