多肽CCPDKILN的參數(shù)和合成路線|三字母為Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|專肽生物產(chǎn)品-定制多肽合成服務(wù)
文章目錄
一、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的結(jié)構(gòu)圖
二、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的多肽參數(shù)
三、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的靜電荷圖
四、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的親疏水比例統(tǒng)計(jì)(條形圖)
五、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)(扇形圖)
六、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn|CCPDKILN的合成步驟
專肽生物官網(wǎng):http://tsjxdd.com (以下圖片均由專肽生物多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器自動(dòng)生成)
一、Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn的結(jié)構(gòu)圖如下
二、Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn的多肽參數(shù)如下
單字母:H2N-CCPDKILN-OH
三字母:H2N-Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn-COOH
中文序列:半胱氨酸-半胱氨酸-脯氨酸-天冬氨酸-賴氨酸-異亮氨酸-亮氨酸-天冬酰胺
氨基酸個(gè)數(shù):8
分子式:C37H64N10O12S2
平均分子量:905.09
精確分子量(Exact Mass):904.41
等電點(diǎn)(PI):8.83
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):1.91
GRAVY值:0.1
親水殘基比例:0.1
消光系數(shù):-
平均親水性及多肽溶解建議:親水(該多肽在純水中溶解性較好,大多數(shù)情況下無(wú)需助溶)
三、H2N-CCPDKILN-OH的靜電荷圖
四、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn的親疏水比例統(tǒng)計(jì)(條形圖)
五、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)(扇形圖)
六、多肽Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.3g CTC Resin(如初始取代度約為1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Asn(Trt)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時(shí)CTC樹脂體積會(huì)增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入樹脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反應(yīng)2-3小時(shí)后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇,封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到Fmoc-Asn(Trt)-CTC Resin備用。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Asn(Trt)-CTC Resin。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取2.7mmol Fmoc-Leu-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
H2N-Cys(Trt)-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Cys(Trt)-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Cys(Trt)-Cys(Trt)-Pro-Asp(OtBu)-Lys(Boc)-Ile-Leu-Asn(Trt)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)圖如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過濾掉樹脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品 Cys-Cys-Pro-Asp-Lys-Ile-Leu-Asn。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。
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