多肽HGDRGKSGWRCTGAF的參數(shù)和合成路線|三字母為His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|專肽生物產(chǎn)品-定制多肽合成服務
文章目錄
一、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的結構圖
二、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的多肽參數(shù)
三、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的靜電荷圖
四、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe|HGDRGKSGWRCTGAF的合成步驟
專肽生物官網(wǎng):http://tsjxdd.com (以下圖片均由專肽生物多肽結構計算器自動生成)
一、His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe的結構圖如下
二、His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe的多肽參數(shù)如下
單字母:H2N-HGDRGKSGWRCTGAF-OH
三字母:H2N-His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe-COOH
中文序列:組氨酸-甘氨酸-天冬氨酸-精氨酸-甘氨酸-賴氨酸-絲氨酸-甘氨酸-色氨酸-精氨酸-半胱氨酸-蘇氨酸-甘氨酸-丙氨酸-苯丙氨酸
氨基酸個數(shù):15
分子式:C69H103N25O20S1
平均分子量:1634.78
精確分子量(Exact Mass):1633.75
等電點(PI):11.49
pH=7.0時的凈電荷數(shù):3.18
GRAVY值:-1.1
親水殘基比例:0.06
消光系數(shù):5500
平均親水性及多肽溶解建議:親水(該多肽在純水中溶解性較好,大多數(shù)情況下無需助溶)
三、H2N-HGDRGKSGWRCTGAF-OH的靜電荷圖
四、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe的親疏水比例統(tǒng)計(條形圖)
五、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(扇形圖)
六、多肽His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.3g CTC Resin(如初始取代度約為1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Phe-OH于反應器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入樹脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反應2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質,有利于后續(xù)反應)。得到Fmoc-Phe-CTC Resin備用。結構圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Phe-CTC Resin。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色)。結構圖如下:
3、縮合:取2.7mmol Fmoc-Ala-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應30分鐘后,用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應做準備)。得到Fmoc-Ala-Phe-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結構圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-Gly-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
H2N-Gly-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
Fmoc-His(Trt)-Gly-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-His(Trt)-Gly-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Gly-Lys(Boc)-Ser(tBu)-Gly-Trp(Boc)-Arg(Pbf)-Cys(Trt)-Thr(tBu)-Gly-Ala-Phe-CTC Resin,結構圖如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品 His-Gly-Asp-Arg-Gly-Lys-Ser-Gly-Trp-Arg-Cys-Thr-Gly-Ala-Phe。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復測下純度 是否目標純度。
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