多肽RIWIHWSFCVDRDLS的參數(shù)和合成路線|三字母為Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|專肽生物產(chǎn)品-定制多肽合成服務(wù)
文章目錄
一、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的結(jié)構(gòu)圖
二、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的多肽參數(shù)
三、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的靜電荷圖
四、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的親疏水比例統(tǒng)計(jì)(條形圖)
五、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)(扇形圖)
六、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser|RIWIHWSFCVDRDLS的合成步驟
專肽生物官網(wǎng):http://tsjxdd.com (以下圖片均由專肽生物多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器自動(dòng)生成)
一、Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser的結(jié)構(gòu)圖如下
二、Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser的多肽參數(shù)如下
單字母:H2N-RIWIHWSFCVDRDLS-OH
三字母:H2N-Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser-COOH
中文序列:精氨酸-異亮氨酸-色氨酸-異亮氨酸-組氨酸-色氨酸-絲氨酸-苯丙氨酸-半胱氨酸-纈氨酸-天冬氨酸-精氨酸-天冬氨酸-亮氨酸-絲氨酸
氨基酸個(gè)數(shù):15
分子式:C89H129N25O22S1
平均分子量:1933.2
精確分子量(Exact Mass):1931.95
等電點(diǎn)(PI):8.56
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):1.18
GRAVY值:-0.02
親水殘基比例:0.12
消光系數(shù):11000
平均親水性及多肽溶解建議:疏水(該多肽在水中的溶解性一般,可選擇以下方式助溶: 1、調(diào)整溶液的PH助溶(含Cys等氨基酸盡量不調(diào)為堿性) 2、超聲助溶(含Cys、Ser等氨基酸需減少超聲時(shí)間) 3、加熱助溶(溶液溫度≤30℃) 4、添加助溶劑(如DMSO,DMF等,建議遵循先有機(jī)溶液后無(wú)機(jī)溶液的原則)。 5、對(duì)于堿性肽,建議用10%乙酸溶解,對(duì)于酸性肽,建議用5-10%氨水溶解。
三、H2N-RIWIHWSFCVDRDLS-OH的靜電荷圖
四、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser的親疏水比例統(tǒng)計(jì)(條形圖)
五、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser的親疏水性氨基酸、極性非極性氨基酸、酸堿性氨基酸的統(tǒng)計(jì)(扇形圖)
六、多肽Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取0.3g CTC Resin(如初始取代度約為1.0mmol/g)和0.4 mmol的Fmoc-Ser(tBu)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時(shí)CTC樹脂體積會(huì)增大好幾倍,避免DCM溶液過(guò)少),再加入樹脂0.9 mmol的DIPEA((Mw:129.1,d:0.740g/ml)),反應(yīng)2-3小時(shí)后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇,封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到Fmoc-Ser(tBu)-CTC Resin備用。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到H2N-Ser(tBu)-CTC Resin。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取2.7mmol Fmoc-Leu-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再分別加入1.8mmol DIPEA,1.67mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Ile-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
H2N-Ile-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
Fmoc-Arg(Pbf)-Ile-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin
最后再經(jīng)過(guò)步驟二得到 H2N-Arg(Pbf)-Ile-Trp(Boc)-Ile-His(Trt)-Trp(Boc)-Ser(tBu)-Phe-Cys(Trt)-Val-Asp(OtBu)-Arg(Pbf)-Asp(OtBu)-Leu-Ser(tBu)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)圖如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過(guò)濾掉樹脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品 Arg-Ile-Trp-Ile-His-Trp-Ser-Phe-Cys-Val-Asp-Arg-Asp-Leu-Ser。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒(méi)有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過(guò)這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。
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