多肽合成是一個重復(fù)添加氨基酸的過程，固相合成順序一般從C端（羧基端）向N端（氨基端）合成。過去的多肽合成是在溶液中進行的，稱為液相合成法。現(xiàn)在多采用固相合成法，從而大大的減輕了每步產(chǎn)品純化的難度。為了防止副反應(yīng)的發(fā)生，參加反應(yīng)的氨基酸的側(cè)鏈都是被保護的，而羧基端是游離的，并且在反應(yīng)之前必須活化。

多肽化學(xué)合成方法有兩種，即Fmoc合成法和Boc合成法。

Boc合成法

    Boc合成法是采用TFA（三氟乙酸）可脫除的Boc（叔丁氧羰基）為α-氨基保護基，側(cè)鏈保護采用芐醇類。合成時 將一個Boc氨基酸衍生物共價交聯(lián)到樹脂上，用TFA脫除Boc，用三乙胺中和游離的氨基末端，然后通過DCC活化，偶聯(lián)下一個氨基酸，最終脫保護多采用 HF法或TFMSA（三氟甲磺酸）法。用Boc法已成功地合成了許多生物大分子，如活性酶、生長因子、人工蛋白等。

    在Boc合成法中，反復(fù)地用酸來脫保護，這種處理帶來了一些問題：如在肽與樹脂的接頭處，當(dāng)每次用50%TFA脫Boc基時，有約1.4%的肽從樹脂上脫 落，合成的肽鏈越長，這樣的損失越嚴(yán)重；此外，酸處理會引起側(cè)鏈的一些副反應(yīng)，Boc合成法尤其不適于合成含有色氨酸等對酸不穩(wěn)定的肽類。

Fmoc合成法

    與Boc合成法的根本區(qū)別在于采用了堿可脫除的Fmoc（9-芴甲氧羰基）為α-氨基的保護基，側(cè)鏈的保護采用TFA可脫除的叔丁氧基等，樹脂采用90%TFA可切除的對烷氧芐醇型樹脂，最終的脫保護避免了強酸處理。

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