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多肽產(chǎn)品

激肽釋放酶(KLK)底物的非標(biāo)記肽, Kallikrein 6 substrate,H2N-Ala-Phe-Arg-Phe-Ser-Gln-Lys-COOH,H2N-AFRFSQK-OH,杭州專肽生物的產(chǎn)品

激肽釋放酶(KLK)底物的非標(biāo)記肽, Kallikrein 6 substrate

編號:426824

CAS號:

單字母:H2N-AFRFSQK-OH

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  • 編號:426824
    中文名稱:激肽釋放酶(KLK)底物的非標(biāo)記肽, Kallikrein 6 substrate
    單字母:H2N-AFRFSQK-OH
    三字母:H2N

    N端氨基:N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí),通常將N端放在肽鏈的左邊。

    -Ala

    丙氨酸:alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸,是編碼氨基酸,也叫L-α-丙氨酸。符號:A,Ala。D-丙氨酸存在于多種細(xì)菌細(xì)胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

    -Phe

    L-苯丙氨酸:phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號:F,Phe。

    -Arg

    L-精氨酸:arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理?xiàng)l件下帶正電荷,為編碼氨基酸。是幼小哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號:R,Arg。

    -Phe

    L-苯丙氨酸:phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號:F,Phe。

    -Ser

    L-絲氨酸:serine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-羥基丙酸。是編碼氨基酸。因可從蠶絲中獲得而得名。符號:S,Ser。在絲原蛋白及某些抗菌素中含有 D-絲氨酸。

    -Gln

    L-谷氨酰胺:glutamine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-氨?;∷?,是編碼氨基酸。符號:GIn,Q。

    -Lys

    L-賴氨酸:lysine。系統(tǒng)命名為(2S)-6-二氨基已酸。是編碼氨基酸中的堿性氨基酸,哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。在蛋白質(zhì)中的賴氨酸可以被修飾為多種形式的衍生物。符號:K,Lys。

    -OH

    C端羧基:C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí),通常將C端放在肽鏈的右邊。

    氨基酸個(gè)數(shù):7
    分子式:C41H62N12O10
    平均分子量:883.01
    精確分子量:882.47
    等電點(diǎn)(PI):-
    pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):2.97
    平均親水性:0.14285714285714
    疏水性值:-0.76
    消光系數(shù):-
    標(biāo)簽:酶底物肽(Substrate Peptide)   

  •  Caspase酶對應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。

           什么是胱天蛋白酶?

          胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。

          人Caspases酶

          人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。

           表1. 人胱天蛋白酶的功能分類:

    細(xì)胞死亡途徑 半胱天冬酶類型 酵素 物種
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 2 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 8 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 9 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 啟動(dòng)器 Caspases 10 人的
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 3 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 6 人與鼠
    細(xì)胞凋亡 效應(yīng)器 Caspases 6 人與鼠
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 1 人與鼠
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 4 人的
    細(xì)胞焦亡 炎性的 Caspases 5 人的

           啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶

          根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識別位

          凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對于形成死亡誘導(dǎo)信號復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對IETD肽序列具有相對較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們在級聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖碜詥?dòng)器Caspase的信號,使用對Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對活化的Caspase-3進(jìn)行檢測,可以檢測Caspase-3的活性。

           Caspase酶底物和抑制劑

          Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識別序列和信號產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對應(yīng)的Caspase識別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號或抑制信號的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。

           表2. Caspase的底物及其序列

    多肽 氨基酸序列 對應(yīng)的Caspase的種類
    IETD Ile-Glu-Thr-Asp Caspase 8,顆粒酶B
    DEVD Asp-Glu-Val-Asp Caspase 3、6、7、8或10
    LEHD Leu-Glu-His-Asp Caspase 9
    VAD Val-Ala-Asp Caspase 1、2、3、6、8、9或10

             Caspase酶的顯色底物

          Caspase的顯色底物是有Caspase識別序列及生色基團(tuán)組成,常見的生色團(tuán)有pNA(對硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測。

           表3. Caspase的顯色底物

    底物 Caspase 吸收(nm) 顏色
    Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * 半胱天冬酶3 405 nm 黃色
    Z-DEVD-pNA 半胱天冬酶3 405 nm 黃色
    Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 405 nm 黃色

           Caspase的熒光底物

          Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測定。

          圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。

           表4.熒光半胱天冬酶底物。

    底物名稱 對應(yīng)的Caspase Ex(nm) Em(nm) ε¹ Φ²
    Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-AFC 半胱天冬酶3、7 376 482 17000 0.53
    Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * 半胱天冬酶3、7 341 441 19000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    (Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * 半胱天冬酶3、7 500 522 80000 N / D
    Z-DEVD-ProRed™620 半胱天冬酶3、7 532 619 N / D N / D
    Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53
    Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * 半胱天冬酶8,顆粒酶B 376 482 17000 0.53

           注意:

            1.ε=在其最大吸收波長處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1-1)。

          2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。

           Caspase抑制劑

          Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。

           表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑

    抑制劑 Caspase的種類 是否可逆 Ex(nm) Em(nm)
    Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * 半胱天冬酶3、7 可逆的 -- --
    Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * 半胱天冬酶8 可逆的 -- --
    mFluor™450-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 406 445
    mFluor™510-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 412 505
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-DEVD-FMK 半胱天冬酶3、7 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FITC-C6-LEHD-FMK 半胱天冬酶9 不可逆的 491 516
    FAM-VAD-FMK 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 493 517
    SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 不可逆的 559 577

  • 暫時(shí)沒有數(shù)據(jù)
  • 編號名稱CAS號
    128981激肽釋放酶(KLK)底物, Kallikrein 6 substrate1926163-28-1
    Abz-AFRFSQ-EDDnp
    迄今為止已描述的最佳人激肽釋放酶6(hK6)FRET底物。