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專注多肽 服務(wù)科研
編號: | 413251 |
中文名稱: | H2N-Asp-Leu-Val-Leu-Arg-pNA |
單字母: | H2N-DLVLR-pNA |
三字母: | H2N N端氨基:N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時,通常將N端放在肽鏈的左邊。 -AspL-天冬氨酸:aspartic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-丁二酸。是編碼氨基酸,又是神經(jīng)遞質(zhì)。符號:D,Asp。D-天冬氨酸存在于多種細菌的細胞壁和短桿菌肽A中。 -LeuL-亮氨酸:leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號:L,Leu。 -ValL-纈氨酸:valine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-甲基丁酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號:V,Val。在某些放線菌素如纈霉素中存在 D-纈氨酸。 -LeuL-亮氨酸:leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號:L,Leu。 -ArgL-精氨酸:arginine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-5-胍基戊酸。在生理條件下帶正電荷,為編碼氨基酸。是幼小哺乳動物的必需氨基酸。符號:R,Arg。 -pNA對硝基苯胺 |
氨基酸個數(shù): | 5 |
分子式: | C33H54N10O9 |
平均分子量: | 734.84 |
精確分子量: | 734.41 |
等電點(PI): | 10.56 |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | 0.98 |
平均親水性: | 0.18 |
疏水性值: | 0.76 |
消光系數(shù): | - |
標簽: | pNA修飾肽 |
多肽H2N-Asp-Leu-Val-Leu-Arg-pNA的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取1.1g CTC Resin(如初始取代度約為0.31mmol/g)和0.41mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時CTC樹脂體積會增大好幾倍,避免DCM溶液過少),再加入1.02mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級甲醇,封端半小時。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮氣30分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Arg(Pbf)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團,茚三酮檢測為藍色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取1.02mmol Fmoc-Leu-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當DMF溶解氨基酸,再依次加入2.05mmol DIPEA,0.97mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測為無色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準備)。得到Fmoc-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
H2N-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
Fmoc-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計算器-多肽結(jié)構(gòu)計算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過步驟二得到 H2N-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、N端臨時Boc保護:加適當DMF到樹脂中,再依次加入4.09mmol DIPEA,2.05mmol Boc酸酐溶液,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。取小樣茚三酮檢測為無色。Boc酸酐:DIPEA:樹脂=6:12:1(摩爾比)。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準備)。 得到 Boc-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)如下:
6、全保護切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹脂,收集濾液(此時多肽已經(jīng)從樹脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Boc-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液??蛇m當旋蒸DCM層溶液,減少有機溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)?;蛲ㄟ^減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對多肽進行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Boc-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。
7、4-硝基苯胺反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當DMF后,再加入1.02mmol 4-硝基苯胺到樹脂中,再加入2.05mmol DIPEA、0.97mmol HBTU,鼓氮氣反應(yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準備)。 得到 Boc-Asp(OtBu)-Leu-Val-Leu-Arg(Pbf)-pNA。 結(jié)構(gòu)如下:
8、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時,過濾掉樹脂,用冰無水乙醚沉淀濾液,并用冰無水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Asp-Leu-Val-Leu-Arg-pNA。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標峰液體,進行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過這時要取小樣復(fù)測下純度 是否目標純度。
10、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://tsjxdd.com)主營定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對或者多對二硫鍵環(huán)),生物素標記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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