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多肽產(chǎn)品

Ala-Thr-Ala-Asp-pNA,H2N-Ala-Thr-Ala-Asp-pNA,H2N-ATAD-pNA,杭州專肽生物的產(chǎn)品

Ala-Thr-Ala-Asp-pNA

編號(hào):401018

CAS號(hào):

單字母:H2N-ATAD-pNA

糾錯(cuò)
  • 編號(hào):401018
    中文名稱:Ala-Thr-Ala-Asp-pNA
    單字母:H2N-ATAD-pNA
    三字母:H2N

    N端氨基:N-terminal amino group。在肽或多肽鏈中含有游離a-氨基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí),通常將N端放在肽鏈的左邊。

    -Ala

    丙氨酸:alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸,是編碼氨基酸,也叫L-α-丙氨酸。符號(hào):A,Ala。D-丙氨酸存在于多種細(xì)菌細(xì)胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

    -Thr

    L-蘇氨酸:threonine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-(3R)-羥基丁酸。有兩個(gè)手性中心,是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào):T,Thr。

    -Ala

    丙氨酸:alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸,是編碼氨基酸,也叫L-α-丙氨酸。符號(hào):A,Ala。D-丙氨酸存在于多種細(xì)菌細(xì)胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。

    -Asp

    L-天冬氨酸:aspartic acid。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-丁二酸。是編碼氨基酸,又是神經(jīng)遞質(zhì)。符號(hào):D,Asp。D-天冬氨酸存在于多種細(xì)菌的細(xì)胞壁和短桿菌肽A中。

    -pNA

    對(duì)硝基苯胺

    氨基酸個(gè)數(shù):4
    分子式:C20H28N6O9
    平均分子量:496.47
    精確分子量:496.19
    等電點(diǎn)(PI):6.26
    pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù):-0.02
    平均親水性:0.4
    疏水性值:-0.15
    消光系數(shù):-
    標(biāo)簽:pNA修飾肽   

  • 多肽H2N-Ala-Thr-Ala-Asp-pNA的合成步驟:

    1、合成CTC樹脂:稱取0.98g CTC Resin(如初始取代度約為0.76mmol/g)和0.89mmol Fmoc-Asp(OtBu)-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時(shí)CTC樹脂體積會(huì)增大好幾倍,避免DCM溶液過(guò)少),再加入2.23mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時(shí)后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇,封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到  Fmoc-Asp(OtBu)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:

    2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Asp(OtBu)-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    3、縮合:取2.23mmol Fmoc-Ala-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入4.47mmol DIPEA,2.12mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測(cè)為無(wú)色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:

    4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到

    H2N-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin

    Fmoc-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin

    H2N-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin

    Fmoc-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin

    以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計(jì)算器-多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器中,一鍵畫出。

    最后再經(jīng)過(guò)步驟二得到 H2N-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:

    5、N端臨時(shí)Boc保護(hù):加適當(dāng)DMF到樹脂中,再依次加入8.94mmol DIPEA,4.47mmol Boc酸酐溶液,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。取小樣茚三酮檢測(cè)為無(wú)色。Boc酸酐:DIPEA:樹脂=6:12:1(摩爾比)。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Boc-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin。結(jié)構(gòu)如下:

    6、全保護(hù)切割:配置0.5%TFA/DCM溶液,溶液體積約為樹脂體積的3倍。再次用DCM洗滌樹脂2遍(去除殘留DMF),后將配置好的溶液倒入到反應(yīng)器中,反應(yīng)30分鐘。抽濾樹脂,收集濾液(此時(shí)多肽已經(jīng)從樹脂上分離,存在于濾液中)。多肽序列為 Boc-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-CTC Resin。 在濾液中添加DIEPA,調(diào)PH至7-8。用飽和NaHCO3洗滌濾液,分離出DCM層溶液??蛇m當(dāng)旋蒸DCM層溶液,減少有機(jī)溶劑。再次加入1或2倍體積的乙酸乙酯,用稀HCl溶液調(diào)PH至微酸性,將多肽從DCM層萃取到乙酸乙酯層。用飽和NaCl洗滌2次乙酸乙酯層。用無(wú)水硫酸鎂吸收乙酸乙酯層的水分。通過(guò)減壓旋蒸,直接將乙酸乙酯完全旋蒸掉,得到晶體狀固體多肽,用于下一步C端反應(yīng)?;蛲ㄟ^(guò)減壓旋蒸保留適量乙酸乙酯的溶液體積,加入冰乙醚析出 多肽,然后對(duì)多肽進(jìn)行烘干操作即可用于下一步C端反應(yīng)。Boc-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-COOH的結(jié)構(gòu)圖如下。

    7、4-硝基苯胺反應(yīng)連接:在上述樹脂中,加入適當(dāng)DMF后,再加入2.23mmol 4-硝基苯胺到樹脂中,再加入4.47mmol DIPEA、2.12mmol HBTU,鼓氮?dú)夥磻?yīng)30分鐘。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。 得到 Boc-Ala-Thr(tBu)-Ala-Asp(OtBu)-pNA。 結(jié)構(gòu)如下:

    8、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過(guò)濾掉樹脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Ala-Thr-Ala-Asp-pNA。結(jié)構(gòu)圖見產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。

    切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%

    2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%

    3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%

    (前兩種適合沒有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)

    9、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過(guò)這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。

    10、最后總結(jié):

    杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://tsjxdd.com)主營(yíng)定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長(zhǎng)肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對(duì)或者多對(duì)二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽等。

    以上所有內(nèi)容,為專肽生物原創(chuàng)內(nèi)容,請(qǐng)勿發(fā)布到其他網(wǎng)站上。

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