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來(lái)源于單純皰疹病毒 (HSV) 糖蛋白 B 的免疫顯性表位,對(duì)應(yīng)其 498-505 殘基序列,可作為 H-2Kb 限制性和 HSV-1/2 交叉反應(yīng)性細(xì)胞毒性 T 淋巴細(xì)胞 (CTL) 識(shí)別表位。
編號(hào):200622
CAS號(hào):149997-91-1
單字母:H2N-SSIEFARL-OH
編號(hào): | 200622 |
中文名稱: | 糖蛋白B(485-492)、Glycoprotein B (485-492) |
英文名: | Glycoprotein B (485-492) |
CAS號(hào): | 149997-91-1 |
單字母: | H2N-SSIEFARL-OH |
三字母: | H2N N端氨基 -Ser絲氨酸 -Ser絲氨酸 -Ile異亮氨酸 -Glu谷氨酸 -Phe苯丙氨酸 -Ala丙氨酸 -Arg精氨酸 -Leu亮氨酸 -OHC端羧基 |
氨基酸個(gè)數(shù): | 8 |
分子式: | C41H67N11O13 |
平均分子量: | 922.04 |
精確分子量: | 921.49 |
等電點(diǎn)(PI): | 10.56 |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | 0.98 |
平均親水性: | -2.7755575615629E-17 |
疏水性值: | 0.41 |
消光系數(shù): | - |
來(lái)源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
儲(chǔ)存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | 病毒學(xué) |
HSV-gB2 (498-505) 是來(lái)源于單純皰疹病毒 (HSV) 糖蛋白 B 的免疫顯性表位,對(duì)應(yīng)其 498-505 殘基序列,可作為 H-2Kb 限制性和 HSV-1/2 交叉反應(yīng)性細(xì)胞毒性 T 淋巴細(xì)胞 (CTL) 識(shí)別表位。
HSV-gB2 (498-505) is an immunodominant epitope from herpes simplex virus (HSV) glycoprotein B residues 498-505, acts as H-2Kb-restricted and HSV-1/2-cross-reactive cytotoxic T-lymphocyte (CTL) recognition epitope.
背景
糖蛋白B(485-492)的化學(xué)式為C41H67N11O13,氨基酸序列為H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-OH,分子量為922.04。糖蛋白B是一種病毒糖蛋白,參與單純皰疹病毒(HSV)進(jìn)入細(xì)胞的過(guò)程。皰疹病毒含有一個(gè)包被和一個(gè)外脂質(zhì)雙層,其中包含12個(gè)表面糖蛋白。單純皰疹病毒包被與細(xì)胞膜融合,經(jīng)過(guò)內(nèi)吞作用,雙鏈DNA基因組進(jìn)入宿主細(xì)胞,產(chǎn)生感染(1)。皰疹病毒糖蛋白B是所有細(xì)胞膜糖蛋白中最高度保守的,主要作為融合蛋白。gB和gH/ gL的精確功能未知,但它們對(duì)于病毒進(jìn)入細(xì)胞是必須的,構(gòu)成核心融合單位。糖蛋白B的胞質(zhì)域內(nèi)的某些突變引起顯著的合胞體表型(2),且與其它病毒融合蛋白具有結(jié)構(gòu)同源性,由此認(rèn)為gB參與了融合過(guò)程(3)。
參考文獻(xiàn):
1. PereiraL, Ali M, Kousoulas K, Huo B, Banks T (September 1989). "Domain structure of herpes simplex virus 1 glycoprotein B: neutralizing epitopes map in regions of continuous and discontinuous residues". Virology 172 (1): 11–24.
2. Bender FC, Samanta M, Heldwein EE, de Leon MP, Bilman E, Lou H, Whitbeck JC, Eisenberg RJ, Cohen GH (April 2007). "Antigenic and mutational analyses of herpes simplex virus glycoprotein B reveal four functional regions". J. Virol. 81 (8): 3827–41.
3. Heldwein EE, Lou H, Bender FC, Cohen GH, Eisenberg RJ, Harrison SC (July 2006). "Crystalstructure of glycoprotein B from herpes simplex virus 1". Science 313 (5784): 217–20.
DOI | 名稱 | |
---|---|---|
10.1006/viro.1993.1346 | Epitope specificity of H-2Kb-restricted, HSV-1-, and HSV-2-cross-reactive cytotoxic T lymphocyte clones | 下載 |
多肽H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-COOH的合成步驟:
1、合成CTC樹脂:稱取2.96g CTC Resin(如初始取代度約為1.14mmol/g)和4.05mmol Fmoc-Leu-OH于反應(yīng)器中,加入適量DCM溶解氨基酸(需要注意,此時(shí)CTC樹脂體積會(huì)增大好幾倍,避免DCM溶液過(guò)少),再加入10.12mmol DIPEA(Mw:129.1,d:0.740g/ml),反應(yīng)2-3小時(shí)后,可不抽濾溶液,直接加入1ml的HPLC級(jí)甲醇,封端半小時(shí)。依次用DMF洗滌2次,甲醇洗滌1次,DCM洗滌一次,甲醇洗滌一次,DCM洗滌一次,DMF洗滌2次(這里使用甲醇和DCM交替洗滌,是為了更好地去除其他溶質(zhì),有利于后續(xù)反應(yīng))。得到 Fmoc-Leu-CTC Resin。結(jié)構(gòu)圖如下:
2、脫Fmoc:加3倍樹脂體積的20%Pip/DMF溶液,鼓氮?dú)?0分鐘,然后2倍樹脂體積的DMF 洗滌5次。得到 H2N-Leu-CTC Resin 。(此步驟脫除Fmoc基團(tuán),茚三酮檢測(cè)為藍(lán)色,Pip為哌啶)。結(jié)構(gòu)圖如下:
3、縮合:取10.12mmol Fmoc-Arg(Pbf)-OH 氨基酸,加入到上述樹脂里,加適當(dāng)DMF溶解氨基酸,再依次加入20.25mmol DIPEA,9.62mmol HBTU。反應(yīng)30分鐘后,取小樣洗滌,茚三酮檢測(cè)為無(wú)色。用2倍樹脂體積的DMF 洗滌3次樹脂。(洗滌樹脂,去掉殘留溶劑,為下一步反應(yīng)做準(zhǔn)備)。得到Fmoc-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin。氨基酸:DIPEA:HBTU:樹脂=3:6:2.85:1(摩爾比)。結(jié)構(gòu)圖如下:
4、依次循環(huán)步驟二、步驟三,依次得到
H2N-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
H2N-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
H2N-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
H2N-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
H2N-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
H2N-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
Fmoc-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin
以上中間結(jié)構(gòu),均可在專肽生物多肽計(jì)算器-多肽結(jié)構(gòu)計(jì)算器中,一鍵畫出。
最后再經(jīng)過(guò)步驟二得到 H2N-Ser(tBu)-Ser(tBu)-Ile-Glu(OtBu)-Phe-Ala-Arg(Pbf)-Leu-CTC Resin,結(jié)構(gòu)如下:
5、切割:6倍樹脂體積的切割液(或每1g樹脂加8ml左右的切割液),搖床搖晃 2小時(shí),過(guò)濾掉樹脂,用冰無(wú)水乙醚沉淀濾液,并用冰無(wú)水乙醚洗滌沉淀物3次,最后將沉淀物放真空干燥釜中,常溫干燥24小試,得到粗品H2N-Ser-Ser-Ile-Glu-Phe-Ala-Arg-Leu-COOH。結(jié)構(gòu)圖見(jiàn)產(chǎn)品結(jié)構(gòu)圖。
切割液選擇:1)TFA:H2O=95%:5%、TFA:H2O=97.5%:2.5%
2)TFA:H2O:TIS=95%:2.5%:2.5%
3)三氟乙酸:茴香硫醚:1,2-乙二硫醇:苯酚:水=87.5%:5%:2.5%:2.5%:2.5%
(前兩種適合沒(méi)有容易氧化的氨基酸,例如Trp、Cys、Met。第三種適合幾乎所有的序列。)
6、純化凍干:使用液相色譜純化,收集目標(biāo)峰液體,進(jìn)行凍干,獲得蓬松的粉末狀固體多肽。不過(guò)這時(shí)要取小樣復(fù)測(cè)下純度 是否目標(biāo)純度。
7、最后總結(jié):
杭州專肽生物技術(shù)有限公司(ALLPEPTIDE http://tsjxdd.com)主營(yíng)定制多肽合成業(yè)務(wù),提供各類長(zhǎng)肽,短肽,環(huán)肽,提供各類修飾肽,如:熒光標(biāo)記修飾(CY3、CY5、CY5.5、CY7、FAM、FITC、Rhodamine B、TAMRA等),功能基團(tuán)修飾肽(疊氮、炔基、DBCO、DOTA、NOTA等),同位素標(biāo)記肽(N15、C13),訂書肽(Stapled Peptide),脂肪酸修飾肽(Pal、Myr、Ste),磷酸化修飾肽(P-Ser、P-Thr、P-Tyr),環(huán)肽(酰胺鍵環(huán)肽、一對(duì)或者多對(duì)二硫鍵環(huán)),生物素標(biāo)記肽,PEG修飾肽,甲基化修飾肽
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