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植物(caricain,木瓜蛋白酶,絲蛋白和菠蘿蛋白酶)和哺乳動物腦(cathepsin B)中硫醇蛋白酶的發(fā)色底物。
編號:127094
CAS號:85901-57-1
單字母:Pyr-FL-pNA
編號: | 127094 |
中文名稱: | 二肽標記肽Pyr-Phe-Leu-對硝基苯胺 |
英文名: | Pyr-Phe-Leu-pNA |
CAS號: | 85901-57-1 |
單字母: | Pyr-FL-pNA |
三字母: | Pyr 焦谷氨酸 -PheL-苯丙氨酸:phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號:F,Phe。 -LeuL-亮氨酸:leucine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-4-甲基戊酸。是編碼氨基酸。是哺乳動物的必需氨基酸。符號:L,Leu。 -pNA對硝基苯胺 |
氨基酸個數(shù): | 2 |
分子式: | C26H31N5O6 |
平均分子量: | 509.55 |
精確分子量: | 509.23 |
等電點(PI): | - |
pH=7.0時的凈電荷數(shù): | - |
平均親水性: | -2.15 |
疏水性值: | 3.3 |
消光系數(shù): | - |
來源: | 人工化學合成,僅限科學研究使用,不得用于人體。 |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲存條件: | 負80℃至負20℃ |
標簽: | pNA修飾肽 酶底物肽(Substrate Peptide) 二肽(Dipeptide) |
Chromogenic substrate for thiol proteinases from plants (caricain, papain, ficin, and bromelain) and from mammalian brain (cathepsin B). pEFL-pNA is also cleaved by a serine carboxypeptidase (HlSCP1) identified in the midgut of the hard tick Haemaphysalis longicornis, which was shown to process hemoglobin.
Caspase酶對應的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導致細胞分解,死亡,吞噬作用和細胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細胞凋亡效應”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分類:
細胞死亡途徑 | 半胱天冬酶類型 | 酵素 | 物種 |
細胞凋亡 | 啟動器 | Caspases 2 | 人與鼠 |
細胞凋亡 | 啟動器 | Caspases 8 | 人與鼠 |
細胞凋亡 | 啟動器 | Caspases 9 | 人與鼠 |
細胞凋亡 | 啟動器 | Caspases 10 | 人的 |
細胞凋亡 | 效應器 | Caspases 3 | 人與鼠 |
細胞凋亡 | 效應器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細胞凋亡 | 效應器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 1 | 人與鼠 |
細胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 4 | 人的 |
細胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 5 | 人的 |
啟動器Caspase和效應器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:啟動器和效應器Caspase酶。啟動器和效應器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點,Caspase酶的識別位
凋亡啟動器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動caspase激活級聯(lián)反應。Caspase-8對于形成死亡誘導信號復合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應子Caspase(例如Caspase 3)并介導線粒體中細胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對IETD肽序列具有相對較高的底物選擇性。凋亡效應胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負責啟動級聯(lián)途徑,但是當被激活時,它們在級聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應器,因為它放大了來自啟動器Caspase的信號,使用對Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對活化的Caspase-3進行檢測,可以檢測Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個關(guān)鍵成分組成:Caspase識別序列和信號產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識別序列不同,一般由三個或四個氨基酸組成(表2)。Caspase酶識別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團修飾,以增強膜的通透性。對應的Caspase識別特定的肽序列為其酶促反應切割位點,釋放產(chǎn)生信號或抑制信號的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號或顏色強度與蛋白水解活性成正比。
表2. Caspase的底物及其序列
多肽 | 氨基酸序列 | 對應的Caspase的種類 |
IETD | Ile-Glu-Thr-Asp | Caspase 8,顆粒酶B |
DEVD | Asp-Glu-Val-Asp | Caspase 3、6、7、8或10 |
LEHD | Leu-Glu-His-Asp | Caspase 9 |
VAD | Val-Ala-Asp | Caspase 1、2、3、6、8、9或10 |
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識別序列及生色基團組成,常見的生色團有pNA(對硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標儀或分光光度計在405 nm處進行光密度檢測。
表3. Caspase的顯色底物
底物 | Caspase | 吸收(nm) | 顏色 |
Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-DEVD-pNA | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 405 nm | 黃色 |
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識別相關(guān)的熒光團,例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過程,其動態(tài)范圍更窄。 建議將R110標記的Caspase底物用于終點法測定,而將AMC和AFC標記的 Caspase底物用于動力學測定。
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。
表4.熒光半胱天冬酶底物。
底物名稱 | 對應的Caspase | Ex(nm) | Em(nm) | ε¹ | Φ² |
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-AFC | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 500 | 522 | 80000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
注意:
1.ε=在其最大吸收波長處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。
2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。
Caspase抑制劑
Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團組成。具有醛官能團的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑
抑制劑 | Caspase的種類 | 是否可逆 | Ex(nm) | Em(nm) |
Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * | 半胱天冬酶3、7 | 可逆的 | -- | -- |
Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * | 半胱天冬酶8 | 可逆的 | -- | -- |
mFluor™450-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 406 | 445 |
mFluor™510-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 412 | 505 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FAM-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 493 | 517 |
SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 559 | 577 |
DOI | 名稱 | |
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10.1002/cbic.200600387 | Cysteine-specific, covalent anchoring of transition organometallic complexes to the protein papain from Carica papaya | 下載 |
10.1111/j.1742-4658.2007.05852.x | Molecular characterization of a blood-induced serine carboxypeptidase from the ixodid tick Haemaphysalis longicornis | 下載 |
10.1159/000109289 | Enzymatic activity in body and fecal extracts of the storage mite Chortoglyphus arcuatus | 下載 |
10.1039/c001630f | (Eta6-arene) ruthenium(II) complexes and metallo-papain hybrid as Lewis acid catalysts of Diels-Alder reaction in water | 下載 |
10.1039/c1ob05482a | Chemically engineered papain as artificial formate dehydrogenase for NAD(P)H regeneration | 下載 |
10.1016/0003-2697(84)90665-1 | L-Pyroglutamyl-L-phenylalanyl-L-leucine-p-nitroanilide--a chromogenic substrate for thiol proteinase assay | 下載 |
10.1016/s0014-5793(98)01194-6 | The enhancing of a cysteine proteinase activity at acidic pH by protein engineering, the role of glutamic 50 in the enzyme mechanism of caricain | 下載 |
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10.1021/je050303e | Systematic Measurements of Peptide Adsorption in Hydrophobic Chromatography | 下載 |