400-998-5282
專注多肽 服務(wù)科研
編號(hào): | 159963 |
中文名稱: | 二肽Cbz-Phe-Ala |
CAS號(hào): | 21881-18-5/17563-25-6 |
單字母: | Z-FA-OH |
三字母: | Cbz N端Cbz保護(hù) -PheL-苯丙氨酸:phenylalanine。系統(tǒng)命名為(2S)-氨基-3-苯基丙酸。是編碼氨基酸。是哺乳動(dòng)物的必需氨基酸。符號(hào):F,Phe。 -Ala丙氨酸:alanine。L-丙氨酸的系統(tǒng)命名為(2S)-氨基丙酸,是編碼氨基酸,也叫L-α-丙氨酸。符號(hào):A,Ala。D-丙氨酸存在于多種細(xì)菌細(xì)胞壁的糖肽中。β-丙氨酸是維生素泛酸和輔酶A的組分。 -OHC端羧基:C-terminal carboxyl group。在肽或多肽鏈中含有游離羧基的氨基酸一端。在表示氨基酸序列時(shí),通常將C端放在肽鏈的右邊。 |
氨基酸個(gè)數(shù): | 2 |
分子式: | C20H22O5N2 |
平均分子量: | 370.4 |
精確分子量: | 370.15 |
等電點(diǎn)(PI): | - |
pH=7.0時(shí)的凈電荷數(shù): | - |
平均親水性: | -1.5 |
疏水性值: | 2.3 |
外觀與性狀: | 白色粉末狀固體 |
消光系數(shù): | - |
來(lái)源: | 人工化學(xué)合成,僅限科學(xué)研究使用,不得用于人體。 |
純度: | 95%、98% |
鹽體系: | 可選TFA、HAc、HCl或其它 |
儲(chǔ)存條件: | 負(fù)80℃至負(fù)20℃ |
標(biāo)簽: | 酶底物肽(Substrate Peptide) CBZ修飾肽 二肽(Dipeptide) |
Sensitive substrate for cathepsin A.
Caspase酶對(duì)應(yīng)的底物,Caspases(半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶,半胱氨酸依賴性天冬氨酸定向蛋白酶)是一類蛋白酶家族,其功能與凋亡(程序性細(xì)胞死亡),壞死和發(fā)燒(炎癥)的過(guò)程密切相關(guān)。
什么是胱天蛋白酶?
胱天蛋白酶(Caspases)是含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,它們是為細(xì)胞凋亡的主要介質(zhì)。多種受體,例如TNF-α 受體,F(xiàn)asL受體,TLR和死亡受體,以及Bcl-2和凋亡抑制劑(IAP)蛋白家族參與并調(diào)節(jié)該caspase依賴性凋亡途徑。一旦Caspase受到上游信號(hào)(外部或內(nèi)在)刺激被激活,即會(huì)參與執(zhí)行下游蛋白底物的水解作用,并觸發(fā)一系列事件,導(dǎo)致細(xì)胞分解,死亡,吞噬作用和細(xì)胞碎片的清除。
人Caspases酶
人的Caspases家族基于序列相似性和生物學(xué)功能等共性主要可分為三大類:第一類由具有長(zhǎng)胱天蛋白酶募集結(jié)構(gòu)域的“炎癥”胱天蛋白酶組成,他們對(duì)P4位上的較大的芳香族或疏水性殘基具有親和力。第二類由具有短的前體結(jié)構(gòu)域的“細(xì)胞凋亡效應(yīng)”胱天蛋白酶組成,而第三類由具有長(zhǎng)的前提結(jié)構(gòu)域的Pap位置具有亮氨酸或纈氨酸底物親和力的“凋亡引發(fā)劑”胱天蛋白酶組成(表1)。
表1. 人胱天蛋白酶的功能分類:
細(xì)胞死亡途徑 | 半胱天冬酶類型 | 酵素 | 物種 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 2 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 8 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 9 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 啟動(dòng)器 | Caspases 10 | 人的 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 3 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細(xì)胞凋亡 | 效應(yīng)器 | Caspases 6 | 人與鼠 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 1 | 人與鼠 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 4 | 人的 |
細(xì)胞焦亡 | 炎性的 | Caspases 5 | 人的 |
啟動(dòng)器Caspase和效應(yīng)器Caspase酶
根據(jù)其在凋亡胱天蛋白酶途徑中的作用,胱天蛋白酶可分為兩類:?jiǎn)?dòng)器和效應(yīng)器Caspase酶。啟動(dòng)器和效應(yīng)器Caspas酶都具有由小亞基和大亞基組成的催化位點(diǎn),Caspase酶的識(shí)別位
凋亡啟動(dòng)器Caspase酶,例如caspase-2,-8,-9和-10可以啟動(dòng)caspase激活級(jí)聯(lián)反應(yīng)。Caspase-8對(duì)于形成死亡誘導(dǎo)信號(hào)復(fù)合物(DISC)是必不可少的,并且在激活后,Caspase-8激活下游效應(yīng)子Caspase(例如Caspase 3)并介導(dǎo)線粒體中細(xì)胞色素c的釋放。Caspase-8已被證明對(duì)IETD肽序列具有相對(duì)較高的底物選擇性。凋亡效應(yīng)胱天蛋白酶例如Caspase-3,-6和-7雖然不負(fù)責(zé)啟動(dòng)級(jí)聯(lián)途徑,但是當(dāng)被激活時(shí),它們?cè)诩?jí)聯(lián)的中間和后續(xù)步驟中起著不可或缺的作用。Caspase-3(CPP32 / apopain)是關(guān)鍵效應(yīng)器,因?yàn)樗糯罅藖?lái)自啟動(dòng)器Caspase的信號(hào),使用對(duì)Caspase-3有選擇性的DEVD肽序列對(duì)活化的Caspase-3進(jìn)行檢測(cè),可以檢測(cè)Caspase-3的活性。
Caspase酶底物和抑制劑
Caspase底物和抑制劑由兩個(gè)關(guān)鍵成分組成:Caspase識(shí)別序列和信號(hào)產(chǎn)生或蛋白酶抑制基序。不同Caspase識(shí)別序列不同,一般由三個(gè)或四個(gè)氨基酸組成(表2)。Caspase酶識(shí)別序列的N端通常有乙?;ˋc)或碳苯甲氧基(Z)基團(tuán)修飾,以增強(qiáng)膜的通透性。對(duì)應(yīng)的Caspase識(shí)別特定的肽序列為其酶促反應(yīng)切割位點(diǎn),釋放產(chǎn)生信號(hào)或抑制信號(hào)的基序。Caspase的顯色和熒光底物均以相似的方式起作用,其中底物的信號(hào)或顏色強(qiáng)度與蛋白水解活性成正比。
表2. Caspase的底物及其序列
多肽 | 氨基酸序列 | 對(duì)應(yīng)的Caspase的種類 |
IETD | Ile-Glu-Thr-Asp | Caspase 8,顆粒酶B |
DEVD | Asp-Glu-Val-Asp | Caspase 3、6、7、8或10 |
LEHD | Leu-Glu-His-Asp | Caspase 9 |
VAD | Val-Ala-Asp | Caspase 1、2、3、6、8、9或10 |
Caspase酶的顯色底物
Caspase的顯色底物是有Caspase識(shí)別序列及生色基團(tuán)組成,常見(jiàn)的生色團(tuán)有pNA(對(duì)硝基苯胺或4-硝基苯胺),可使用酶標(biāo)儀或分光光度計(jì)在405 nm處進(jìn)行光密度檢測(cè)。
表3. Caspase的顯色底物
底物 | Caspase | 吸收(nm) | 顏色 |
Ac-DEVD-pNA * CAS 189950-66-1 * | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-DEVD-pNA | 半胱天冬酶3 | 405 nm | 黃色 |
Z-IETD-pNA * CAS 219138-21-3 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 405 nm | 黃色 |
Caspase的熒光底物
Caspase的熒光底物的結(jié)構(gòu)包含與半胱天冬酶識(shí)別相關(guān)的熒光團(tuán),例如7-氨基-4-甲基香豆素(AMC),7-氨基-4-三氟甲基香豆素(AFC), Rhodamine 110(R110)或ProRed™620。R110的Caspase底物比基于香豆素的Caspase底物(例如AMC和AFC)更敏感,但由于兩步裂解過(guò)程,其動(dòng)態(tài)范圍更窄。 建議將R110標(biāo)記的Caspase底物用于終點(diǎn)法測(cè)定,而將AMC和AFC標(biāo)記的 Caspase底物用于動(dòng)力學(xué)測(cè)定。
圖.從左到右,分別是AMC(7-氨基-4-甲基香豆素),AFC(7-氨基-4-三氟甲基香豆素),Rhodamine 110(R110)和ProRed™620的激發(fā)和發(fā)射光譜。
表4.熒光半胱天冬酶底物。
底物名稱 | 對(duì)應(yīng)的Caspase | Ex(nm) | Em(nm) | ε¹ | Φ² |
Ac-DEVD-AFC * CAS 201608-14-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Ac-DEVD-AMC * CAS 169332-61-0 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-AFC | 半胱天冬酶3、7 | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-DEVD-AMC * CAS 1135416-11-3 * | 半胱天冬酶3、7 | 341 | 441 | 19000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
(Z-DEVD)2 -R110 * CAS 223538-61-2 * | 半胱天冬酶3、7 | 500 | 522 | 80000 | N / D |
Z-DEVD-ProRed™620 | 半胱天冬酶3、7 | 532 | 619 | N / D | N / D |
Ac-IETD-AFC * CAS 211990-57-7 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
Z-IETD-AFC * CAS 219138-02-0 * | 半胱天冬酶8,顆粒酶B | 376 | 482 | 17000 | 0.53 |
注意:
1.ε=在其最大吸收波長(zhǎng)處的摩爾消光系數(shù)(單位= cm -1M -1)。
2.Φ=水性緩沖液(pH 7.2)中的熒光量子產(chǎn)率。
Caspase抑制劑
Caspase抑制劑能與Caspase的活性位點(diǎn)結(jié)合并形成可逆或不可逆的連接,通常,Caspase抑制劑的結(jié)構(gòu)由Caspase識(shí)別序列,諸如醛(-CHO)或氟甲基酮(-FMK)的官能團(tuán)組成。具有醛官能團(tuán)的胱天蛋白酶抑制劑是可逆的,而具有FMK的抑制劑是不可逆的。半胱天冬酶底物和抑制劑都具有較小的細(xì)胞毒性作用,因此,它們是研究半胱天冬酶活性的有用工具。
表5. 可逆和不可逆的Caspase酶抑制劑
抑制劑 | Caspase的種類 | 是否可逆 | Ex(nm) | Em(nm) |
Ac-DEVD-CHO * CAS 169332-60-9 * | 半胱天冬酶3、7 | 可逆的 | -- | -- |
Ac-IETD-CHO * CAS 191338-86-0 * | 半胱天冬酶8 | 可逆的 | -- | -- |
mFluor™450-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 406 | 445 |
mFluor™510-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 412 | 505 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-DEVD-FMK | 半胱天冬酶3、7 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FITC-C6-LEHD-FMK | 半胱天冬酶9 | 不可逆的 | 491 | 516 |
FAM-VAD-FMK | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 493 | 517 |
SRB-VAD-FMK [磺胺丁胺B-VAD-FMK] | 半胱天冬酶1,2,3,6,8,9,10 | 不可逆的 | 559 | 577 |
H.Matsuzaki et al., J. Biochem., 123, 701(1998) : http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&db=PubMed&dopt=Citation&list_uids=9538264