作者:Rongsheng Ma,?Qing-Feng Li, Aidong Wang, Jiahai Zhang, Zhijun Liu, Jihui Wu, Xuncheng Su*, Ke Ruan*
摘要:?激發(fā)態(tài)在蛋白折疊、分子識別、酶催化等方面發(fā)揮著重要作用,但由于豐度很低,大多數(shù)的結(jié)構(gòu)生物學(xué)手段難以表征激發(fā)態(tài)構(gòu)象。核磁共振化學(xué)交換飽和轉(zhuǎn)移實(shí)驗(yàn)可以獲取與蛋白基態(tài)慢交換的激發(fā)態(tài)化學(xué)位移。然而僅通過化學(xué)位移計(jì)算結(jié)構(gòu)面臨著巨大的挑戰(zhàn),因此迫切需要開發(fā)新的技術(shù)以獲取激發(fā)態(tài)的更多結(jié)構(gòu)信息。我們提出了贗接觸位移-化學(xué)交換飽和傳遞(PCS-CEST)方法,測定的激發(fā)態(tài)贗接觸位移富含蛋白質(zhì)中各原子的距離和取向的結(jié)構(gòu)信息。我們首先在Abp1p SH3-Ark1p慢交換體系中驗(yàn)證了這一方法,激發(fā)態(tài)的贗接觸位移與結(jié)合小肽時(shí)的數(shù)據(jù)吻合很好。我們繼而發(fā)現(xiàn)FF結(jié)構(gòu)域激發(fā)態(tài)的贗接觸位移遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于基態(tài)的數(shù)值,這說明自由的FF結(jié)構(gòu)域預(yù)先存在著蛋白折疊中間體,其構(gòu)象是基本無序的。最后提出了選擇性的一維CEST實(shí)驗(yàn),可以用更少的時(shí)間、更高的數(shù)據(jù)分辨率,來獲取激發(fā)態(tài)的化學(xué)位移和贗接觸位移。
文章的第一作者是我院博士生馬榮聲。通信作者是南開大學(xué)的蘇循成副教授和中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)的阮科副教授。文章作為Featured article在期刊back cover特別推薦。研究得到了科技部973項(xiàng)目和國家基金委的經(jīng)費(fèi)支持。
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論文鏈接:http://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2016/CP/C6CP01127F
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