(轉自武漢大學新聞網(wǎng)訊)(通訊員葉雯)6月27日,Cell(《細胞》)以長文(Article)形式在線發(fā)表了我校醫(yī)學研究院、免疫與代謝前沿科學中心肖銳研究員與美國加州大學圣地亞哥分校(UCSD)付向東教授課題組的最新研究成果。
論文題為“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcription”《RNA結合蛋白廣泛地與染色質相互作用以實現(xiàn)RNA介導的轉錄調控》。肖銳是該文的共同第一作者和通訊作者。
RNA結合蛋白在轉錄后的剪接加工、修飾、轉運、細胞定位、穩(wěn)定性、翻譯和降解等RNA代謝過程中發(fā)揮著重要的調控功能,但其在轉錄水平的調控功能和機制尚未有系統(tǒng)的研究。通過ChIP-seq(染色質免疫沉淀測序)技術大規(guī)模檢測了63個有細胞核定位的RNA結合蛋白與染色質的相互作用,肖銳研究員等意外地發(fā)現(xiàn)約60%的RNA結合蛋白與染色質有廣泛的相互作用,并且富集在基因啟動子和增強子區(qū)域。
更令人驚訝的是,該研究雖然只檢測了人類基因組中一小部分的RNA結合蛋白(<5%),卻發(fā)現(xiàn)約40%的活性染色質區(qū)域和約70%的活性啟動子區(qū)域都存在RNA結合蛋白的特異性結合,這提示RNA結合蛋白在染色質水平存在著廣泛的功能和作用。隨后,通過GRO-seq(Global Nuclear Run-On測序)實驗證實,部分RNA結合蛋白具有強烈的轉錄調控作用。
該研究還重點闡釋了RNA結合蛋白RBM25通過調控轉錄因子YY1與染色質的結合,進而調控染色質結構和轉錄激活與抑制的分子機制,全面展示了特異性的RNA結合蛋白介導的轉錄因子YY1的功能調控作用。整個發(fā)現(xiàn)提出了RNA結合蛋白作為轉錄因子或輔助因子調控轉錄的新概念,也開辟了RNA結合蛋白功能研究的新領域。
肖銳研究員是醫(yī)學研究院2017年引進的優(yōu)秀歸國人才,本科和博士畢業(yè)于武漢大學生命科學學院,博士和博士后期間師從RNA研究領域專家UCSD的付向東教授,至今一直專注于自己熱愛的RNA生物學和功能基因組學領域開展研究工作,并取得了一系列重要的成果。近年來,肖銳研究員作為第一作者和通訊作者在Cell(1篇),Nature(2篇)和Molecular Cell(2篇)等頂尖期刊上發(fā)表了多篇高水平研究論文。
美國加州大學圣地亞哥分校陳加余博士和梁征宇博士為該論文共同第一作者,付向東教授為共同通訊作者,共同作者包括武漢大學周宇教授和羅大極副教授,清華大學魯志教授、張奇?zhèn)ソ淌诤完愱栔硌芯繂T,廈門大學劉文教授,美國MIT Christopher Burge教授,UCSD Gene Yeo教授,康涅狄格大學Brenton Graveley教授和加拿大蒙特利爾大學Eric Lecuyer教授。該工作得到了國家自然科學基金以及武漢大學“雙一流”人才科研啟動經(jīng)費的資助。
原文鏈接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.06.001
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