近日,夏寧邵教授團(tuán)隊(duì)在《細(xì)胞》子刊《細(xì)胞?宿主與微生物》(Cell Host & Microbe)上在線發(fā)表題為“Cryo-EM Structures Reveal the Molecular Basis of Receptor-Initiated Coxsackievirus Uncoating”的研究論文。該研究闡明了柯薩奇B組病毒(Coxsackievirus B,CVB)與其高度依賴的功能性受體柯薩奇病毒-腺病毒受體(Coxsackievirus and Adenovirus Receptor,CAR)相互作用及變構(gòu)過程的精細(xì)特征,從分子水平上揭示了CAR介導(dǎo)CVB病毒高效脫衣殼的作用機(jī)制與關(guān)鍵位點(diǎn),并指引發(fā)現(xiàn)了可模擬受體作用特征誘導(dǎo)CVB成熟病毒顆粒失穩(wěn)及崩解的獨(dú)特的高效治療性抗體。這是夏寧邵教授團(tuán)隊(duì)近年來在《自然?通訊》(Nature Communications,2017)、《科學(xué)?進(jìn)展》(Science Advances,2018)、《自然?微生物學(xué)》(Nature Microbiology,2019)和《細(xì)胞?宿主與微生物》(Cell Host & Microbe,2020)上發(fā)表腸道病毒重要病原體CVA6、CVA10、EVD68和CVA16研究論文后的又一項(xiàng)重要研究成果,可為CVB疫苗及抗病毒藥物研究提供關(guān)鍵基礎(chǔ),豐富了對病毒與受體相互作用機(jī)制的認(rèn)識(shí),為開發(fā)靶向病毒受體結(jié)合域的高效廣譜抗病毒藥物提供重要參考和理論基礎(chǔ)。
柯薩奇B組病毒(CVB)是可導(dǎo)致多種嚴(yán)重疾病的腸道病毒病原體,可通過糞口等途徑傳播,傳染性強(qiáng),可感染嬰幼兒、青少年及成年人,在全球存在廣泛流行。CVB有6種血清型(CVB1~6),均可引發(fā)重要疾病,包括發(fā)熱、手足口病、腹瀉、腦炎、腦膜炎、心肌炎、胰腺炎、急性弛緩性麻痹等,甚至死亡。研究發(fā)現(xiàn),CVB感染與近年來發(fā)病率不斷上升的病毒性胰腺炎、病毒性心肌炎存在密切聯(lián)系,是導(dǎo)致I型糖尿病和青少年心源性致死的主因之一,具有嚴(yán)重的危害性。開展CVB防治的重要性和公共衛(wèi)生意義已被高度重視,但目前尚無CVB特效治療藥物和預(yù)防疫苗,相關(guān)藥物是當(dāng)前抗腸道病毒研究的重要方向。然而,目前對于CVB的基礎(chǔ)病毒學(xué)特別是潛在的高效抗病毒靶標(biāo)及效應(yīng)分子作用機(jī)制仍缺乏清晰認(rèn)識(shí),嚴(yán)重制約了相關(guān)研究的有效開展。
CAR是CVB感染作用高度依賴的功能性細(xì)胞受體,也被稱為脫衣殼受體(Uncoating receptor)。CAR結(jié)合可誘導(dǎo)CVB成熟病毒顆粒的不可逆變構(gòu)進(jìn)而促進(jìn)核酸釋放,在CVB感染中具有關(guān)鍵作用。CVB-CAR結(jié)合域是發(fā)現(xiàn)廣譜抗病毒靶標(biāo)的理想目標(biāo)。然而,目前對CVB與CAR相互作用的精確特征與詳細(xì)作用機(jī)制仍缺乏清晰認(rèn)識(shí),也尚未發(fā)現(xiàn)并精確鑒定CVB的CAR結(jié)合域潛在的高效抗病毒表位的精確信息及靶向性中和抗體,是研制新型疫苗或抗病毒藥物亟需解決的核心科學(xué)問題。
該研究通過構(gòu)建并解析CVB病毒顆粒及與CAR受體復(fù)合物的高分辨率結(jié)構(gòu),獲得在中性pH條件下的一系列代表病毒感染不同階段的近原子分辨率結(jié)構(gòu),包括CVB1成熟顆粒(Mature virion)、低溫和生理溫度下CAR結(jié)合的CVB1前體脫衣殼中間態(tài)(Pre-A-particle)、脫衣殼中間態(tài)(A-particle)和空心顆粒(Empty particle),捕捉到CVB成熟病毒顆粒脫衣殼過程的多種不同中間態(tài)及CAR受體相互作用域的一系列的精細(xì)構(gòu)象變化特征。研究顯示,CAR結(jié)合在病毒表面由衣殼蛋白VP1形成的五倍軸周圍的“峽谷”(canyon)區(qū)域,相比于其它已知的腸道病毒脫衣殼受體,CAR結(jié)合更為深入峽谷凹槽部分,在生理中性pH條件下即可誘導(dǎo)峽谷內(nèi)部VP1疏水“口袋”(pocket)的塌陷,使得疏水口袋內(nèi)部維持腸道病毒顆粒穩(wěn)定性的脂質(zhì)分子(又稱“口袋因子”,pocket factor)釋放,從而啟動(dòng)成熟病毒顆粒的脫衣殼進(jìn)程,推動(dòng)病毒進(jìn)一步變構(gòu)成脫衣殼中間態(tài)及空心顆粒,完成病毒完整的脫衣殼及基因組釋放過程。該研究闡釋了CAR結(jié)合驅(qū)動(dòng)CVB感染的分子作用機(jī)制,揭示了CVB與CAR之間精確的相互作用方式、結(jié)構(gòu)域特征與關(guān)鍵氨基酸位點(diǎn),發(fā)現(xiàn)受體結(jié)合域上可作為潛在高效抗病毒靶標(biāo)的結(jié)構(gòu)域與關(guān)鍵位點(diǎn)。基于上述發(fā)現(xiàn)的指引,該研究篩選到可模擬受體作用特征誘導(dǎo)CVB成熟病毒顆粒失穩(wěn)及崩解的獨(dú)特的高效中和抗體5F5。研究發(fā)現(xiàn),5F5可通過空間位阻效應(yīng)阻斷或競爭CAR與CVB的相互作用,不僅能夠模擬受體與病毒顆粒的相互作用,還可以通過誘導(dǎo)受體CAR結(jié)合域的關(guān)鍵靶點(diǎn)VP2 EF-loop的構(gòu)象變化從而破壞病毒衣殼的穩(wěn)定性,并最終導(dǎo)致成熟病毒顆粒裂解而發(fā)揮高效的中和作用。
該研究豐富了腸道病毒感染及與受體相互作用機(jī)制的基礎(chǔ)理論,發(fā)現(xiàn)受體結(jié)合域的關(guān)鍵抗病毒靶標(biāo)的精確信息和效應(yīng)抗體分子,對開展新型疫苗免疫原和抗病毒藥物的理性設(shè)計(jì)和應(yīng)用開發(fā)具有重要價(jià)值和意義。
博士后徐龍發(fā)、鄭清炳高級工程師、博士生朱瑞、博士生尹志超、俞海副教授為該論文共同第一作者。夏寧邵教授、程通教授、李少偉教授和美國加州大學(xué)洛杉磯分校納米系統(tǒng)研究所Z. Hong Zhou(周正洪)教授為該論文的共同通訊作者。該研究獲得了國家自然科學(xué)基金、新藥創(chuàng)制國家科技重大專項(xiàng)、傳染病防治國家科技重大專項(xiàng)、國家博士后科學(xué)基金資助項(xiàng)目和美國國立衛(wèi)生研究院基金的支持。
論文鏈接:https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(21)00001-9
(圖/文國家傳染病診斷試劑與疫苗工程技術(shù)研究中心)
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