加州大學(xué)圣地亞哥分校鐘聲教授應(yīng)邀到福建省藥物新靶點(diǎn)研究重點(diǎn)實(shí)驗室進(jìn)行學(xué)術(shù)講座
? ? 12月25日下午，加州大學(xué)圣地亞哥分校生物工程系鐘聲教授應(yīng)邀蒞臨福建省藥物新靶點(diǎn)研究重點(diǎn)實(shí)驗室，作了題為“Systematic mapping of RNA-chromatin interactions in vivo”的學(xué)術(shù)講座。重點(diǎn)實(shí)驗室劉文教授主持了講座。劉教授首先對鐘聲教授的到來表示了誠摯的感謝和熱烈的歡迎，繼而介紹了其取得的一系列重要研究成果。
? ? 講座上鐘聲教授提出MARGI（映射RNA-基因組相互作用）的方法，這是一種大規(guī)模揭示未受干擾的細(xì)胞的天然RNA-染色質(zhì)相互作用的技術(shù)。該技術(shù)的要點(diǎn)是通過鄰近連接將染色質(zhì)相關(guān)的RNA（caRNA）與其靶基因組序列連接，形成RNA-DNA嵌合序列，將其轉(zhuǎn)化為測序文庫進(jìn)行配對末端測序。該課題組利用MARG1技術(shù)制作了人胚胎干細(xì)胞（ESC）和人胚腎（HEK）細(xì)胞的RNA-基因組相互作用圖譜，并且利用MARGI技術(shù)揭示了數(shù)百種caRNA，包括先前已知的XIST，SNHG1，NEAT1和MALATL，以及每種caRNA的基因組相互作用基因座。通過跨物種實(shí)驗，估計大約2.2％的MARGI鑒定的相互作用是假陽性。在ESC和HEK細(xì)胞中，通過MARGI技術(shù)的檢測，結(jié)果顯示與其相應(yīng)DNA末端的位置相比，超過5％的RNA末端被定位到遠(yuǎn)端或染色體間位置。大多數(shù)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)與遠(yuǎn)端或染色體間caRNA相關(guān)。根據(jù)染色質(zhì)免疫沉淀測序（ChlP-seq）報告結(jié)果顯示H3K27ac和H3K4me3水平呈正相關(guān)，而根據(jù)顯示RNA附著水平的MARGI報告，結(jié)果表明H3K9me3是呈負(fù)相關(guān)。MARGI技術(shù)將有助于揭示新的RNA功能及其基因組靶區(qū)域。
? ? 鐘聲是加州大學(xué)圣地亞哥分校生物工程系教授，同時擔(dān)任美國國立衛(wèi)生研究院共同基金四維核體組織中心 (NIH Common Fund 4D Nucleome Organizational Hub) 主任和美國醫(yī)學(xué)與生物工程院會士 (AIMBE Fellow)。他主要研究基因調(diào)控如何影響細(xì)胞行為。實(shí)驗室通過開發(fā)新的生物技術(shù)來繪制分子網(wǎng)絡(luò)，包括RNA-RNA 相互作用組，RNA-DNA相互作用組和蛋白質(zhì)相互作用組, 進(jìn)而開發(fā)基于核酸的體外檢測方法和治療技術(shù)。他在《自然》,《細(xì)胞》等雜志上發(fā)表了多篇文章。他的工作兩次被《自然》雜志以研究亮點(diǎn)和研究工具的形式進(jìn)行評價。他獲得過美國國家衛(wèi)生局局長先鋒獎(NIH Director’s Pioneer Award), 美國國家衛(wèi)生局局長創(chuàng)新者獎(NIH Director’s New Innovator Award), 美國國家自然基金CAREER獎，斯隆獎。
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