近日,北京大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究所李川昀課題組與臺(tái)灣長(zhǎng)庚大學(xué)譚賢明教授合作,首次發(fā)現(xiàn)并命名一類含有RNA編輯位點(diǎn)的piRNA分子,揭示RNA編輯可能對(duì)piRNA生成起到功能性的調(diào)控作用,在靈長(zhǎng)類中首次建立了RNA編輯與piRNA調(diào)控的功能聯(lián)系。題為“Selectively Constrained RNA Editing Regulation Crosstalks with piRNA Biogenesis in Primates”的研究論文在《Molecular Biology and Evolution》雜志發(fā)表。
RNA編輯可引起基因組與其編碼的轉(zhuǎn)錄組在特定位點(diǎn)的序列差異。近年來(lái),數(shù)以萬(wàn)計(jì)的RNA編輯位點(diǎn)被報(bào)道,而這些調(diào)控多數(shù)(>99%)位于不編碼蛋白質(zhì)的基因組區(qū)域。這些非編碼性的編輯調(diào)控是否具有生物學(xué)功能,是該領(lǐng)域懸而未解的難題。李川昀課題組前期運(yùn)用猴的人類近緣優(yōu)勢(shì),獲得了精確的猴全編輯組,并從分子演化角度首次證明非編碼區(qū)的RNA編輯在理論上具有功能性(PLoS Genetics, 2014)。然而,它們具體通過(guò)怎樣的調(diào)控途徑來(lái)實(shí)現(xiàn)其功能呢?
在本文中,作者針對(duì)猴多組織、多個(gè)體、多調(diào)控層次開(kāi)展了系統(tǒng)的組學(xué)研究,發(fā)現(xiàn)了一類由發(fā)生RNA編輯的長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本前體經(jīng)剪切而形成的piRNA分子,并將其命名為epiRNA(editing-bearing PIWI-interacting RNA)。研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)RNA編輯對(duì)piRNA生成具有顯著的促進(jìn)作用,而這些發(fā)生在epiRNA上的RNA編輯事件正經(jīng)歷著顯著的負(fù)向自然選擇作用(Purifying Selection),提示在人類、猴等靈長(zhǎng)類動(dòng)物中,與piRNA調(diào)控的互作可能是RNA編輯發(fā)揮生物學(xué)功能的主要途徑之一。
本文首次建立了RNA編輯與piRNA調(diào)控之間的功能聯(lián)系,為針對(duì)這兩類調(diào)控的機(jī)制研究提供了新視角。北京大學(xué)分子醫(yī)學(xué)研究所楊欣壯、陳加余同學(xué)為本文并列第一作者。該研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金、國(guó)家973項(xiàng)目等經(jīng)費(fèi)支持。
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