近日,我校生科院鐘伯堅課題組在綠藻系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)研究方面取得進(jìn)展。相關(guān)研究成果以“Chloroplast Phylogenomic Inference of Green Algae Relationships”在Nature旗下期刊Scientific Reports (IF: 5.578) 發(fā)表。生科院基地班11級本科生孫林華為該文章第一作者,鐘伯堅教授為通訊作者。
文章鏈接:http://www.nature.com/articles/srep20528
綠藻的生命形式多樣,生長環(huán)境廣泛,不僅在整個生態(tài)系統(tǒng)中占據(jù)重要地位,而且具有相對復(fù)雜的進(jìn)化歷史,因此綠藻的系統(tǒng)進(jìn)化研究一直是植物學(xué)關(guān)注的熱點(diǎn)。鐘伯堅課題組利用綠藻大規(guī)模的葉綠體基因組數(shù)據(jù),結(jié)合系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)的研究手段,探討了綠藻各個綱之間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。同時對堿基異質(zhì)性、位點(diǎn)進(jìn)化速率和堿基替代模型適合度的相關(guān)性進(jìn)行了分析,發(fā)現(xiàn)進(jìn)化速率較快的位點(diǎn),其堿基異質(zhì)性較高,對模型的適合度較差。這為今后植物分子系統(tǒng)學(xué)的研究提供了有效的分析手段。
該項工作得到了國家自然科學(xué)基金、江蘇省自然科學(xué)基金、江蘇省優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)項目、南京師范大學(xué)“百人計劃”和本科優(yōu)秀畢業(yè)設(shè)計(論文)培育計劃等項目的支持。
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