?近日,RNA領(lǐng)域權(quán)威期刊RNA以“The S. pombe mitochondrial transcriptome”為題在線發(fā)表了的生命科學(xué)學(xué)院黃鷹教授課題組關(guān)于裂殖酵母線粒體轉(zhuǎn)錄組的最新研究進(jìn)展。RNA雜志由冷泉港出版社出版發(fā)行,是RNA領(lǐng)域的經(jīng)典旗艦期刊。
?線粒體是真核生物生產(chǎn)能量的細(xì)胞器,通過氧化磷酸化合成ATP。此外,線粒體參與許多重要的細(xì)胞過程,包括氨基酸和脂肪酸合成,活性氧物質(zhì)產(chǎn)生,細(xì)胞凋亡和衰老。線粒體功能障礙與許多重要疾病相關(guān),其中包括癌癥,神經(jīng)退行性疾病,線粒體遺傳性疾病以及和代謝紊亂疾病如糖尿病有關(guān)。粟酒裂殖酵母作為一種簡(jiǎn)單的真核模式生物,其與哺乳動(dòng)物細(xì)胞的呼吸生理及線粒體基因組組成方面都極具相似性。因此粟酒裂殖酵母是一個(gè)很有潛力的線粒體研究模型。?
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該論文主要分析了裂殖酵母線粒體基因表達(dá)以及轉(zhuǎn)錄后過程控制,包括線粒體RNA(mt-RNA)加工,修飾,衰變和質(zhì)量控制。缺陷的線粒體基因表達(dá)導(dǎo)致線粒體氧化磷酸化缺乏并且已經(jīng)涉及多種人類疾病。為了完全了解線粒體轉(zhuǎn)錄和RNA加工,我們對(duì)來自裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)的mt-RNA進(jìn)行了RNA-seq分析。RNA-seq分析表明,mt-RNA的豐度差異很大。數(shù)據(jù)分析還揭示了mt-RNA精確加工位點(diǎn),包括線粒體tRNA(mt-tRNA)5'-末端加工酶RNase P的非典型的RNA切割。此外,該論文研究揭示了先前未知的線粒體轉(zhuǎn)錄物,包括tRNA 5'-末端加工酶RNase P RNA成分衍生的片段;線粒體小RNA(mitosRNA),例如mt-tRNA衍生的片段(mt-tRF)和mt-tRNA半分子;以及在粟酒裂殖酵母中用3'-CCACCA / CCACC標(biāo)記的mt-tRNA。最后,RNA-seq揭示了編碼粟酒裂殖酵母線粒體tRNA 3'末端加工酶的trz2失活導(dǎo)致mt-tRNA 3'末端加工全局性損害;抑制mt-mRNA 5'-末端加工并導(dǎo)致未加工轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的積累;證明使用RNA-seq檢測(cè)已知或預(yù)測(cè)參與粟酒裂殖酵母中mt-RNA加工的蛋白質(zhì)的可行性。我們的工作揭示了真菌線粒體轉(zhuǎn)錄組的復(fù)雜性,并為使用S. pombe作為線粒體研究模型提供了框架。
相關(guān)研究發(fā)表在RNA學(xué)領(lǐng)域權(quán)威雜志RNA上(文章鏈接:http://rnajournal.cshlp.org/content/early/2018/06/28/rna.064477.117.abst...),商巾杰副教授為第一作者,黃鷹教授為通訊作者,相關(guān)研究受到國(guó)家自然科學(xué)基金、江蘇省優(yōu)勢(shì)學(xué)科建設(shè)項(xiàng)目等的支持。
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