2018年12月27日,清華大學(xué)生命學(xué)院植物生物學(xué)研究中心戚益軍研究組在《發(fā)育細(xì)胞》(Developmental Cell)在線發(fā)表了題為《葉綠體到細(xì)胞核逆行信號(hào)調(diào)控?cái)M南芥microRNA生成》(Chloroplast-to-Nucleus Signaling Regulates MicroRNA Biogenesis in Arabidopsis)的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)了葉綠體逆行信號(hào)可以調(diào)控?cái)M南芥microRNA(miRNA)的生成,并揭示了該調(diào)控機(jī)制在擬南芥耐熱性獲得方面的重要作用。
miRNA是一類長約21個(gè)核苷酸的內(nèi)源小RNA,它們從其前體(primary miRNA, pri-miRNA)在細(xì)胞核內(nèi)被Dicer-like 1 (DCL1)加工產(chǎn)生,與效應(yīng)蛋白Argonaute1結(jié)合后通過切割靶標(biāo)mRNA或抑制翻譯等方式調(diào)節(jié)基因表達(dá)。葉綠體是植物細(xì)胞重要的細(xì)胞器。它不僅是光合作用的中心,而且是植物感受內(nèi)源和外界環(huán)境刺激的感受器之一。葉綠體可以利用代謝過程中產(chǎn)生的小分子,通過逆行信號(hào)通路將環(huán)境刺激傳遞至細(xì)胞核,調(diào)控核內(nèi)基因表達(dá)。
在這項(xiàng)研究中,研究者通過正向遺傳篩選獲得到了一個(gè)嚴(yán)重影響miRNA產(chǎn)生的突變體cue1. CUE1是一個(gè)定位于葉綠體內(nèi)膜的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,它可以將化合物PEP轉(zhuǎn)運(yùn)至葉綠體內(nèi)并通過Shikimate 通路代謝產(chǎn)生三種芳香族氨基酸 (Tyr, Phe, and Trp)。遺傳學(xué)分析表明,三種芳香族氨基酸中的Tyr,而不是Phe和Trp,為miRNA的積累所必需。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),Tyr通過生成下游代謝產(chǎn)物維生素E調(diào)控miRNA生成。戚益軍研究組隨后深入研究了維生素E 調(diào)控miRNA生成的作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)維生素E可通過葉綠體逆行信號(hào)分子PAP,抑制核內(nèi)RNA外切酶XRN2的活性,使得pri-miRNA 免于降解,從而促進(jìn)miRNA的生成。此外,該研究還發(fā)現(xiàn)miRNA通路的逆行信號(hào)調(diào)控模式對(duì)于擬南芥熱脅迫下耐熱性的獲得具有重要意義。
該研究首次揭示了葉綠體逆行信號(hào)通路可調(diào)控細(xì)胞核內(nèi)miRNA 的生成,這對(duì)理解葉綠體逆行信號(hào)通路和miRNA通路的調(diào)控機(jī)制都具有重要意義。
清華大學(xué)生命學(xué)院植物生物學(xué)研究中心博士后方曉峰和博士生趙高展為該論文的共同第一作者。戚益軍為論文通訊作者。該研究由國家自然科學(xué)基金委、科技部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃和清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心提供經(jīng)費(fèi)支持。
圖1,葉綠體逆行信號(hào)通路調(diào)控核內(nèi)miRNA生成
文章鏈接:https://www.cell.com/developmental-cell/fulltext/S1534-5807(18)31030-X
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