?????? 近日,上海交通大學(xué)呂海濤研究員再次受邀在組學(xué)與質(zhì)譜學(xué)領(lǐng)域著名雜志《Mass Spectrometry Reviews》(中科院分區(qū)1區(qū)TOP級雜志,影響因子9.526)發(fā)表評論文章“Mass spectrometry and associated technologies delineate the advantageously biomedical capacity of siderophores in different pathogenic contexts”。本文由上海交大系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院呂海濤課題組與黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)王喜軍教授和哈爾濱醫(yī)科大學(xué)姚麗教授聯(lián)合發(fā)表。本文首次在全球代謝組學(xué)領(lǐng)域內(nèi)定義精準(zhǔn)修飾代謝組學(xué)(precision-modification metabolomics)這一創(chuàng)新方法學(xué)策略,主要用于快速推進鐵載體為核心的生物醫(yī)藥創(chuàng)新應(yīng)用研究,同時未來將該方法開發(fā)成功后(方法學(xué)研究進行中),可以廣泛用于不同疾病的基礎(chǔ)與精準(zhǔn)轉(zhuǎn)化應(yīng)用研究, 呂海濤課題組未來將深度聚焦胰腺癌與肝癌的代謝調(diào)控機理與組分中藥發(fā)現(xiàn)研究,以期為這些復(fù)雜疾病的臨床精準(zhǔn)診斷和有效治療貢獻方法學(xué)智慧。
?????? 本文系統(tǒng)梳理不同疾病背景下,鐵載體在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的優(yōu)勢應(yīng)用價值與潛力,并從致病性關(guān)聯(lián)鐵載體的結(jié)構(gòu)多樣性和化學(xué)生物學(xué)角度進行系統(tǒng)歸納,以人體不同組織器官獲得性傳染性疾病的種類、病源菌類型和鐵載體結(jié)構(gòu)與功能為評述主線,重點聚焦提煉鐵載體生物合成對于這些復(fù)雜性傳染性疾病的臨床診斷、病源機理闡釋,和治療藥物發(fā)現(xiàn)的核心價值與應(yīng)用前景。同時,有研究發(fā)現(xiàn)鐵載體的生物合成與多種非傳染性疾病的發(fā)生發(fā)展亦密切相關(guān),如癌癥、心血管和神經(jīng)系統(tǒng)疾病等,源于這些疾病的發(fā)病進程中多伴有多種病源菌的器官系統(tǒng)感染, 因此鐵載體生物合成有望成為打開這些疾病診斷,病源機理與藥物治療等復(fù)雜暗箱的金鑰匙, 重點為后續(xù)胰腺癌代謝特征譜與多器官轉(zhuǎn)移的驅(qū)動因子發(fā)現(xiàn)研究提供一個全新視角。目前新鐵載體的發(fā)現(xiàn)與化學(xué)生物學(xué)研究尚未成熟,究其原因是缺乏行之有效的從系統(tǒng)代謝角度解決這些關(guān)鍵科學(xué)問題的方法學(xué)策略,必將嚴(yán)重影響鐵載體在生物醫(yī)藥領(lǐng)域最核心價值的發(fā)揮。
????? ?近兩年,呂海濤課題組在前期應(yīng)用開發(fā)代謝組學(xué)-遺傳學(xué)整合策略的基礎(chǔ)上致力于一個全新的代謝組學(xué)方法學(xué)研究,即精準(zhǔn)修飾代謝組學(xué)(Precision-Modification Metabolomics), 其核心理念為重塑小分子代謝通路,一方面靶向覆蓋目標(biāo)代謝通路的關(guān)鍵底物/前體,代謝中間體和終端產(chǎn)物;另一方面同位素質(zhì)譜示蹤碳源和代謝旁路歸屬;最后靶向定性/定量刻畫每一步代謝反應(yīng)的關(guān)鍵催化酶和調(diào)控基因。其核心目標(biāo)為基于該重塑代謝通路進行生物醫(yī)藥應(yīng)用研究,突破傳統(tǒng)代謝組學(xué)僅限于代謝表型表征,精準(zhǔn)闡釋不同生物事件/過程驅(qū)動下的代謝修飾的生物學(xué)功能和代謝調(diào)控機理。
?????? 本次發(fā)文上海交通大學(xué)為第一通訊單位,羅夏琳、郭睿及徐欣為共同第一作者,呂海濤研究員為第一通訊作者,王喜軍教授和姚麗教授為共同通訊作者。該系統(tǒng)研究工作得到國家重點研發(fā)計劃課題,國家自然科學(xué)基金面上項目,上海交通大學(xué)特別研究員啟動項目和QUT Vice Chancellor’s Research Fellowship(國際人才基金)的大力支持。
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作者:羅夏琳
編輯:王華瑤
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