?????? 2019年11月月5日.?著名雜志Mass Spectrometry Reviews?(2018影響因子為9.068)為紀(jì)念主編 Dominic M. Desiderio教授卓越貢獻(xiàn)Proteomics, Mass Spectrometry, Neurobiology 等領(lǐng)域30年,推出2019 Honorable Issue,特邀上海交通大學(xué)呂海濤研究員結(jié)合課題組近年來的代謝組學(xué)實(shí)踐研究和未來創(chuàng)新規(guī)劃,起草題為:“FUNCTIONAL METABOLOMICS DECIPHER BIOCHEMICAL FUNCTIONS AND ASSOCIATED MECHANISMS UNDERLIE SMALL-MOLECULE METABOLISM”的細(xì)胞代謝與代謝組學(xué)專題戰(zhàn)略評(píng)述文章 (Critical Review),重點(diǎn)評(píng)述過去10年代謝組學(xué)在細(xì)胞代謝關(guān)鍵科學(xué)問題解決方面的研究進(jìn)展,并梳理其局限不足、提出未來發(fā)展方向和全新解決方案。文章重點(diǎn)定義并提出表型代謝組學(xué)(Phenotypic Metabolomics),聚焦其與功能代謝組學(xué)(Functional Metabolomics)的共性優(yōu)勢(shì)和局限,未來代謝與代謝組學(xué)研究應(yīng)該走向功能代謝組學(xué)支撐的代謝修飾與功能調(diào)控研究,多組學(xué)/生物化學(xué)前沿策略的的系統(tǒng)介入聯(lián)姻,將是必由之路。?
?????? 上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院呂海濤研究員為論文通訊作者,上海交通大學(xué)為唯一通訊單位,2018級(jí)博士生胡龍龍、2018級(jí)碩士生劉京凈、2018級(jí)聯(lián)合培養(yǎng)碩士生張文華和2019級(jí)碩士生王天宇為論文共同第一作者,黑龍江中醫(yī)藥大學(xué)張寧教授和新加坡國(guó)立大學(xué)Lee Yie Hou教授為共同作者。論文相關(guān)主題工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃課題、國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目、上海交通大學(xué)高層次人才啟動(dòng)基金和中央高校基本科研業(yè)務(wù)費(fèi)重大創(chuàng)新專項(xiàng)的資金支持。
??????本文主要內(nèi)容如下:小分子代謝/Small-Molecule Metabolism 提供所有生命體細(xì)胞(人、動(dòng)物、植物和微生物等)生長(zhǎng)、增值、分化和功能化所必須的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)(Nutrients),能量 (Energy Charges)和微環(huán)境(Biochemical Environments)。代謝組學(xué)/Metabolomics 作為后基因時(shí)代,系統(tǒng)生物學(xué)驅(qū)動(dòng)的新生代組學(xué)技術(shù),其核心價(jià)值是通過定性描述和定量表征不同生物基質(zhì)中小分子代謝組以闡明與細(xì)胞代謝相關(guān)的所有關(guān)鍵科學(xué)問題。進(jìn)而,我們可以從代謝維度認(rèn)識(shí)不同的生物化學(xué)過程和生物學(xué)事件,如疾病的發(fā)生/診斷、藥物作用/毒理、營(yíng)養(yǎng)健康/干預(yù)、植物生理/病理、微生物感染/治療,環(huán)境毒理/修復(fù),基因突變/修飾等。然而,過去的十年,代謝組學(xué)的發(fā)展,同其它生命組學(xué)(Life-Omics)一樣,面臨一個(gè)巨大困局。由于我們現(xiàn)有技術(shù)手段和生物化學(xué)認(rèn)知的局限性,當(dāng)下,組學(xué)研究仍處于表型數(shù)據(jù)的高通量采集與初步分析水平,即我們定義為表型代謝組學(xué)研究?(Phenotypic Metabolomics),若要尋求真正解決上述與代謝相關(guān)的關(guān)鍵科學(xué)問題,功能代謝組學(xué)研究(Functional Metabolomics),勢(shì)在必行。
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原文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/mas.21611
稿件來源:呂海濤課題組
圖文編輯:王華瑤
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