韓澤廣團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞及單突變分辨率的肝癌克隆進(jìn)化重構(gòu)
?????? 近日，上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院韓澤廣、蘇現(xiàn)斌團(tuán)隊(duì)與復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院、劍橋大學(xué)、悉尼大學(xué)等國(guó)內(nèi)外團(tuán)隊(duì)合作，在著名學(xué)術(shù)期刊《血液學(xué)與腫瘤學(xué)雜志》（Journal of Hematology & Oncology）（影響因子11.059）發(fā)表題為“Clonal evolution in liver cancer at single-cell and single-variant resolution”的論文，報(bào)道了單細(xì)胞及單突變水平的人類肝癌克隆進(jìn)化重構(gòu)工作。
?????? 一般認(rèn)為腫瘤起源于單細(xì)胞，其后隨著分裂進(jìn)行遺傳變異逐步積累，腫瘤內(nèi)的細(xì)胞可能含有不同的突變組合并形成克隆群體。腫瘤克隆會(huì)不斷進(jìn)化以適應(yīng)環(huán)境，與臨床治療、轉(zhuǎn)移等密切相關(guān)。針對(duì)肝癌的遺傳異質(zhì)性分析此前多停留在群體樣本水平或多區(qū)域組織取樣，近期進(jìn)一步在單細(xì)胞拷貝數(shù)變化層面開展，但未能達(dá)到單細(xì)胞及點(diǎn)突變分辨率。
?????? 為解決這一問題，該團(tuán)隊(duì)采用單細(xì)胞全基因組擴(kuò)增結(jié)合混合外顯子測(cè)序來鎖定克隆性及亞克隆性相關(guān)點(diǎn)突變，進(jìn)一步通過單細(xì)胞靶向擴(kuò)增測(cè)序來揭示單個(gè)腫瘤細(xì)胞中的突變情況。通過對(duì)來自4例肝癌病人腫瘤組織及癌旁組織共480個(gè)單細(xì)胞的靶向測(cè)序分析，該團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)不同肝癌病人間存在突變異質(zhì)性，且不同腫瘤的克隆結(jié)構(gòu)也不盡相同。基于單細(xì)胞突變組合，即使腫瘤組織為單一時(shí)間點(diǎn)取樣，也可以有效實(shí)現(xiàn)其克隆進(jìn)化歷史的重構(gòu)。其中，針對(duì)一例病人原發(fā)灶和門靜脈癌栓（PVTT）的分析發(fā)現(xiàn)，二者共同起源但轉(zhuǎn)移應(yīng)該很早發(fā)生，此后原發(fā)灶和PVTT獨(dú)立進(jìn)化演變。單細(xì)胞克隆重建進(jìn)一步揭示了腫瘤進(jìn)化中每一步的堿基改變模式，為可能的腫瘤病因提供線索。
與免責(zé)聲明：本網(wǎng)頁(yè)的內(nèi)容由收集互聯(lián)網(wǎng)上公開發(fā)布的信息整理獲得。目的在于傳遞信息及分享，并不意味著贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其真實(shí)性，也不構(gòu)成其他建議。僅提供交流平臺(tái)，不為其版權(quán)負(fù)責(zé)。如涉及侵權(quán)，請(qǐng)聯(lián)系我們及時(shí)修改或刪除。郵箱：sales@allpeptide.com</p></div></div></div><!-- 上下 --></div><!-- 底部 --><div id=)
返回首頁(yè) 浙公網(wǎng)安備 33010602009704號(hào);浙ICP備18001318號(hào)