Scientific Reports—方玉達(dá)研究組發(fā)現(xiàn)植物長(zhǎng)鏈非編碼RNA參與藍(lán)光信號(hào)傳導(dǎo)并與microRNA形成競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA
光和長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA) 是植物生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中重要的外部和內(nèi)部調(diào)節(jié)因子，但是對(duì)于lncRNA在光信號(hào)傳導(dǎo)中的功能及其機(jī)制知之甚少。上海交通大學(xué)/中國(guó)科學(xué)院植物生理生態(tài)所方玉達(dá)研究組通過(guò)lncRNA高通量測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)光誘導(dǎo)了部分lncRNA的表達(dá)譜發(fā)生變化，其中一個(gè)藍(lán)光誘導(dǎo)lncRNA(blue light-induced lncRNA, 簡(jiǎn)稱為BLIL1)在藍(lán)光下具有抑制胚軸伸長(zhǎng)的功能。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)lncRNA-BLIL1與miRNA167能夠形成競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA (competing endogenous RNA，ceRNA)，從而調(diào)節(jié)植物胚軸伸長(zhǎng)。該研究進(jìn)一步證明非編碼RNA在光信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程中有重要功能。
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該研究是方玉達(dá)研究組發(fā)現(xiàn)miRNA加工相關(guān)的nuclear dicing bodies（D-body）與光信號(hào)傳導(dǎo)相關(guān)的nuclear photobodies功能密切聯(lián)系(PLoS Genetics, 11(10): e1005598; 14(3):e1007247)系列研究工作的延伸。
上述研究成果于2020年4月10日在線發(fā)表于上Scientific Reports，題為：Genome-wide identification of Arabidopsis long noncoding RNAs in response to the blue light。孫鎮(zhèn)菲博士為論文第一作者，方玉達(dá)教授為論文通訊作者。相關(guān)研究得到了國(guó)家自然科學(xué)基金的資助。
原文鏈接： https://www.nature.com/articles/s41598-020-63187-1
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