2019年1月8日,清華大學醫(yī)學院生物醫(yī)學工程系郭永實驗室合作在《分析學家》(Analyst)在線發(fā)表題為《基于多重微液滴數(shù)字PCR的胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前檢測方法》(A Multiplex Droplet Digital PCR Assay for Non-invasive Prenatal Testing of Fetal Aneuploidy)的研究論文,該研究利用數(shù)字PCR技術(shù)檢測孕婦外周血中的游離DNA,建立了一種胎兒染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前檢測的新方法。
胎兒染色體非整倍體異常是嚴重的出生缺陷,最常見的包括21-三體綜合征(即唐氏綜合征,其未干預的綜合發(fā)病率高達1/750,且隨著孕婦年齡增加風險急劇增大)、18-三體綜合征和13-三體綜合征等。這類疾病將導致新生兒出現(xiàn)智力低下、生長發(fā)育遲緩、多發(fā)畸形乃至死亡,且尚無有效治療手段,而產(chǎn)前篩查和診斷可最有效的避免此類患兒的出生。自孕婦外周血中發(fā)現(xiàn)游離胎兒DNA以來,研究人員對其展開大量研究,發(fā)展出基于二代測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測技術(shù)(NIPT),此技術(shù)比傳統(tǒng)唐氏綜合征血清學篩查更準確,比羊水穿刺更安全。因為其無創(chuàng)、安全、準確的特點,受到醫(yī)生和孕婦的認可并被臨床快速接受,是目前二代測序技術(shù)最為成功的臨床應用。然而,基于二代測序的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測技術(shù)尚存在檢測周期長,需要1-2周出檢測報告、技術(shù)門檻高、檢測費用貴等不足,阻礙了其替代傳統(tǒng)產(chǎn)前篩查方法成為全面普查項目。
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為了解決上述不足,在這項研究中,研究人員使用具有單分子檢測靈敏度和絕對定量能力的數(shù)字PCR技術(shù),開發(fā)了一種簡單有效的染色體非整倍體的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測新方法。該研究使用孕婦外周血,能夠?qū)σ粋€樣本在約4.5小時完成無創(chuàng)產(chǎn)前檢測(圖1)。研究人員首先通過理論計算,研究能夠精準分辨21-三體綜合征的影響因素和邊界條件;接著設計40對引物和2個鎖核酸(LNA)通用探針擴增21號和18號染色體上的各20個片段,驗證了理論預測的可靠性,評估了檢測方法的性能指標;最后通過60例臨床樣本對方法的準確性和臨床適用性進行了初步評估,結(jié)果顯示所有臨床樣本檢測結(jié)果與基于二代測序技術(shù)的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測結(jié)果一致率為100%。
圖1. 基于數(shù)字PCR的染色體非整倍體無創(chuàng)產(chǎn)前檢測方法流程圖
該研究為無創(chuàng)產(chǎn)前檢測領(lǐng)域提供了一種新的實用性思路,對于如何用數(shù)字PCR技術(shù)進行無創(chuàng)產(chǎn)前篩查的診斷試劑開發(fā)給出了可行的設計原則。在醫(yī)療控費的背景下,開發(fā)快速簡便的方法對于在大規(guī)模人群開展無創(chuàng)產(chǎn)前檢測具有重要意義。隨著國內(nèi)數(shù)字PCR平臺的自主研發(fā)與技術(shù)創(chuàng)新,基于數(shù)字PCR的無創(chuàng)產(chǎn)前檢測技術(shù)有望實現(xiàn)準確、快速、簡便的產(chǎn)前篩查。
陳芊如和陳西華為該論文的共同第一作者,祝令香研究員和郭永研究員對該研究進行了指導,這項研究得到了國家衛(wèi)健委科學技術(shù)研究所和北京新羿生物科技有限公司的大力支持。本課題得到國家自然科學基金、中央公益性科研機構(gòu)基金、企業(yè)橫向合作課題等的經(jīng)費資助。
◎論文鏈接:
https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2019/an/c8an02018c/unauth#!divAbstract
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