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2020年12月7日,北京大學化學與分子工程學院、北大-清華生命科學聯(lián)合中心陳興課題組在《自然-方法》(Nature Methods)雜志在線發(fā)表了題為“Click-ExM enables expansion microscopy for all biomolecules”的研究論文,報道了基于點擊化學的膨脹顯微成像技術(Click-ExM),提供了一種通用、便捷的策略對各種生物分子進行超分辨熒光成像。
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“工欲善其事,必先利其器”。探尋生命的奧秘,首先需要看得足夠清楚。然而由于光學衍射極限的限制,常規(guī)的熒光顯微鏡難以對精細的亞細胞結構進行分辨。超分辨熒光成像技術,使人們能夠看清在200 nm以內(nèi)的生物分子。不過這些技術通常依賴于昂貴的儀器和精密的算法,而且在組織樣品中的成像性能一般。
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膨脹顯微成像技術(Expansion microscopy,ExM)則從樣品制備入手,繞過了光學衍射極限,實現(xiàn)了讓超分辨熒光成像“飛入尋常百姓家”。整個流程中首先將丙烯酸鹽充滿整個生物樣品內(nèi)部,并使其聚合形成凝膠。凝膠吸水膨脹后,原本臨近的生物分子被拉遠,但相對位置保持不變。因此利用常規(guī)的熒光顯微鏡對膨脹后的樣品進行成像,同樣可實現(xiàn)超分辨的成像效果。然而目前的ExM技術缺乏一種普適性的在凝膠中錨定生物分子的策略,因此其應用范圍局限于蛋白質、核酸,無法對脂質、聚糖以及小分子等生物分子進行成像。
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Click-ExM的工作流程(以炔基標記的生物分子為例)
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Click-ExM的設計理念是利用帶有生物正交官能團(如疊氮、炔基等)的化學探針對細胞進行代謝標記,通過點擊化學連接上生物素,再基于生物素與鏈霉親和素相互作用,最終將被標記的生物分子轉變?yōu)榕歼B熒光分子的鏈霉親和素。偶連熒光分子的鏈霉親和素在其中起到了三方面作用:識別生物分子、報告熒光信號、錨定到凝膠中。
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作者采用了多種含有生物正交官能團的化學探針,對脂質、聚糖、蛋白質、核酸、小分子等多種生物分子進行Click-ExM成像,并將該技術應用于原代細胞和腦組織切片等生物體系中,其中首次實現(xiàn)了對多種脂質、聚糖以及小分子的ExM成像。同時,由于Click-ExM技術與傳統(tǒng)的ExM流程兼容,因此可與多種現(xiàn)有的標記方法相結合,實現(xiàn)多色熒光成像。此外,由于樣品膨脹會稀釋熒光分子的濃度,作者還利用鏈霉親和素的多價相互作用,開發(fā)出信號放大策略,有助于成像低豐度的生物分子。值得一提的是,Click-ExM技術中各步均為模塊化設計,且大部分化學試劑可商業(yè)化購買,不需要繁瑣的化學合成和步驟優(yōu)化,因此有希望被廣泛應用于后續(xù)的生物學研究中。
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總之,該工作利用了前沿的化學生物學手段,建立了一種通用型的ExM技術:Click-ExM,并拓展了其在超分辨熒光成像領域中的應用。
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陳興教授為該研究論文的通訊作者,北京大學化學與分子工程學院2016級博士研究生孫德恩為第一作者。該工作中的部分化學探針、細胞和組織樣品制備分別在北京大學雷曉光、王世強、饒毅教授課題組進行。該研究工作得到了國家自然科學基金委、科技部、北京分子科學國家研究中心、北大-清華生命科學聯(lián)合中心的資助。
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原文鏈接:https://doi.org/10.1038/s41592-020-01005-2
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