????? 在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中,種子大小是重要的農(nóng)藝性狀之一,也是關(guān)鍵的產(chǎn)量構(gòu)成因素。隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的植物物種或品種的基因組信息為人們所知。因此,利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study, GWAS)的方法追溯重要表型背后潛在的調(diào)控基因是區(qū)別于傳統(tǒng)遺傳學(xué)篩選的有效新途徑。模式植物擬南芥(Arabidopsis thaliana)具有分布廣泛、表型變異多樣、未經(jīng)人工馴化的特點(diǎn),是挖掘自然遺傳變異對(duì)表型影響的理想材料。雖然研究者們經(jīng)過(guò)多年的努力已經(jīng)尋找到了一系列控制擬南芥種子大小的重要基因,但其中大部分在調(diào)控種子大小的同時(shí)還會(huì)對(duì)植物的正常生長(zhǎng)發(fā)育以及育性產(chǎn)生不利影響。
????? 鄧興旺/何光明研究團(tuán)隊(duì)利用來(lái)自全球各地的不同擬南芥生態(tài)型,進(jìn)行種子大小調(diào)控新因子的挖掘。通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,鑒定出38個(gè)與種子大小顯著相關(guān)的SNP(Single Nucleotide Polymorphism)位點(diǎn)。其中位于2號(hào)染色體的一個(gè)SNP位點(diǎn)附近存在一個(gè)編碼細(xì)胞周期蛋白的基因CYCB1;4(At2g26760)。該基因特異地表達(dá)在受精前胚珠中,并在胚珠受精后逐漸轉(zhuǎn)移到發(fā)育的胚中。該基因在胚珠中的表達(dá)水平與“大種子”群體生態(tài)型種子的大小呈顯著正相關(guān)。過(guò)量表達(dá)該基因會(huì)導(dǎo)致細(xì)胞周期加快、種子變大、產(chǎn)量提高的表型。敲除該基因會(huì)使使種子變小,但對(duì)于苗期生長(zhǎng)沒(méi)有任何影響。CYCB1;4的缺失對(duì)于“大種子”群體生態(tài)型的影響尤為明顯。由于CYCB1;4是在擬南芥自然群體中發(fā)現(xiàn)的,因此在馴化過(guò)的作物群體中可能并不易被找到。該研究從而為作物育種提供了新的參考靶點(diǎn)。
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