????? 選擇性剪接是指基因表達(dá)過(guò)程中,前體mRNA內(nèi)含子剪接時(shí),選擇不同剪接位點(diǎn)從而生成不同轉(zhuǎn)錄本的現(xiàn)象,是基因轉(zhuǎn)錄時(shí)加工后處理的一個(gè)重要步驟。選擇性剪接能調(diào)控基因的表達(dá)和增加蛋白質(zhì)產(chǎn)物的多樣性,對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)和發(fā)育有著重要的影響。植物中存在大量的內(nèi)含子選擇性剪接現(xiàn)象,在植物的生長(zhǎng)發(fā)育及應(yīng)對(duì)外界脅迫反應(yīng)中起十分重要的作用,然而其在基因組層面的調(diào)控機(jī)制并不清楚。
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????? 何光明/鄧興旺課題組利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的方法,對(duì)擬南芥Col-0以及其它四種生態(tài)型內(nèi)含子選擇性剪接的差異進(jìn)行了分析。同時(shí)以Col-0為母本,配制了其余4種生態(tài)型與Col-0的雜交子一代,利用親本和雜交子一代的轉(zhuǎn)錄組分析內(nèi)含子選擇性剪接的順?lè)词秸{(diào)控機(jī)制。研究表明,擬南芥中內(nèi)含子選擇性剪接的變化主要受到順式效應(yīng)的調(diào)控,與剪接位點(diǎn)周圍基因組序列變化有關(guān),且受到寡聚嘧啶序列的影響?;蚬δ芨患治霭l(fā)現(xiàn),生態(tài)型間有選擇性剪接差異的基因富集在脅迫響應(yīng)相關(guān)通路中,而這些基因的表達(dá)水平在生態(tài)型間并沒(méi)有差異。全基因組關(guān)聯(lián)分析發(fā)現(xiàn),基因組上一些影響剪接位點(diǎn)強(qiáng)度的序列變異同時(shí)也與脅迫響應(yīng)有關(guān)?;谝陨辖Y(jié)果,作者認(rèn)為植物中內(nèi)含子選擇性剪接的變化主要受到剪接位點(diǎn)周圍基因組序列變異的順式作用調(diào)控,在功能上可能與植物對(duì)外界刺激響應(yīng)相關(guān)。
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