華大生科訊 近期，我院張征鋒老師在作物抗逆的生物信息學研究領域取得系列進展，研究成果分別發(fā)表于“自然”子刊Scientific Reports和植物學優(yōu)秀期刊Plant Physiology。
干旱脅迫是影響植物生長的主要環(huán)境因子之一，近年來高通量測序技術與生物信息學的飛速發(fā)展為進一步深入研究脅迫應答機制提供了良好的契機。 在以水稻與旱稻為實驗材料進行干旱脅迫下的比較轉錄組分析中，張征鋒老師與華中農業(yè)大學團隊合作挖掘到436個水稻與旱稻中差異表達的基因，并預測其主要功能與脅迫防御相關；在兩個研究品系中檢測到豐富的變異，包括70264個SNPs及2564個INDELs；1041個直系同源基因被檢測在水稻與旱稻分化過程中受到強烈正選擇，多數(shù)基因富集在光合作用系統(tǒng)中；與干旱脅迫下光合作用參數(shù)相關QTLs的整合分析揭示了受正選擇的光合作用基因位于這些調控植物干旱脅迫響應的數(shù)量性狀位點內；進一步的生理實驗也證明了光合作用機器在水稻與旱稻之間的差異是旱稻應答干旱脅迫過程中的重要優(yōu)勢所在。另外，張征鋒老師與比利時安特衛(wèi)普大學團隊合作，參與完成玉米干旱脅迫下苗期葉片基因表達的芯片數(shù)據(jù)分析及細胞動力學分析。該系列成果為今后作物適應干旱脅迫的進一步深入研究打下了良好基礎。
據(jù)悉，張征鋒老師近年來致力于計算生物學和遺傳學的研究，主要研究方向涉及比較基因組學、轉錄調控研究相關的高通量數(shù)據(jù)分析（基因差異表達、選擇性剪切、基因進化選擇模式、遺傳變異）、微生物宏基因組數(shù)據(jù)分析、基因家族與代謝路徑進化分析、植物生長的細胞動力學分析等。
文章鏈接：http://www.nature.com/articles/srep19349
http://www.plantphysiol.org/content/169/2/1382.long
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