近日,北京大學(xué)化學(xué)與分子工程學(xué)院王初課題組和陳興課題組合作在《自然-化學(xué)生物學(xué)》(Nature Chemical Biology)雜志上發(fā)表論文,報(bào)道了他們利用新一代半胱氨酸糖探針,結(jié)合定量化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),系統(tǒng)鑒定衣康酸在巨噬細(xì)胞內(nèi)修飾位點(diǎn),并揭示衣康酸對(duì)糖酵解負(fù)反饋調(diào)控發(fā)揮抗炎作用新機(jī)制的工作。
小分子代謝物和蛋白的相互作用在各種生物學(xué)過程中都發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,發(fā)展化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)系統(tǒng)分析蛋白-代謝物相互作用網(wǎng)絡(luò)可以促進(jìn)對(duì)其生物學(xué)意義的理解。衣康酸是近年來在巨噬細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的一類具有顯著抗炎活性的代謝小分子, 但其抗炎機(jī)制尚不明確。由于衣康酸具有一個(gè)α,β不飽和羧酸的結(jié)構(gòu),理論上它可以通過邁克爾加成反應(yīng)共價(jià)修飾到蛋白質(zhì)的半胱氨酸殘基上。此前,兩個(gè)課題組合作發(fā)現(xiàn),用于非天然糖代謝標(biāo)記的全乙?;B氮糖探針,在細(xì)胞中可以通過無酶催化形式標(biāo)記蛋白質(zhì)組中大量的半胱氨酸位點(diǎn)(Qin W., et al. Angew. Chem. Int. Ed. 2018.)?;谠摲磻?yīng),兩個(gè)課題組在本工作中合作開發(fā)了新一代特異性半胱氨酸標(biāo)記糖探針1-OH-Az,并結(jié)合定量化學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),成功地在巨噬細(xì)胞蛋白質(zhì)組中鑒定到260個(gè)衣康酸修飾的半胱氨酸位點(diǎn)。作者進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn)糖酵解中的三個(gè)關(guān)鍵酶ALODA,GAPDH和LDHA都可以被衣康酸修飾,其中最上游的ALDOA蛋白中兩個(gè)半胱氨酸(Cys73和Cys339)上在被脂多糖刺激的巨噬細(xì)胞中發(fā)生了內(nèi)源的衣康酸修飾。生化和細(xì)胞實(shí)驗(yàn)表明衣康酸可以通過修飾這兩個(gè)半胱氨酸殘基顯著地抑制ALDOA的催化活性,進(jìn)而抑制巨噬細(xì)胞內(nèi)的糖酵解通路,從而發(fā)揮抗炎活性。
該工作近日以 “S-glycosylation-based cysteine profiling reveals regulation of glycolysis by itaconate”為題發(fā)表在《自然-化學(xué)生物學(xué)》雜志上(doi: 10.1038/s41589-019-0323-5),王初研究員和陳興教授為該論文的共同通訊作者,論文第一作者為他們共同指導(dǎo)的交叉學(xué)院2014級(jí)研究生秦為。該工作獲得基金委“生物大分子動(dòng)態(tài)修飾與化學(xué)干預(yù)”重大研究計(jì)劃和科技部“蛋白質(zhì)機(jī)器與生命過程調(diào)控”重點(diǎn)專項(xiàng)等項(xiàng)目的資助。
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