通訊員李鑫
由我校生物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院計(jì)算生物學(xué)中心、信息學(xué)院、以及美國(guó)三所大學(xué)研究人員發(fā)展的基因表達(dá)可塑性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的建模與計(jì)算研究取得原創(chuàng)性突破。
該模型以信息熵理論為基礎(chǔ)，對(duì)基因表達(dá)與環(huán)境互作的內(nèi)在機(jī)理進(jìn)行聚類分析和依賴關(guān)系量化分析，能夠發(fā)現(xiàn)基因表達(dá)受環(huán)境影響的概貌、因果關(guān)系和量化細(xì)節(jié)。
這一成果近期在線發(fā)表在國(guó)際著名學(xué)術(shù)刊物 Nucleic Acids Research （最新影響因子8.026）上，首次以基因可塑性為變量進(jìn)行互信息的計(jì)算和分析，發(fā)現(xiàn)了基因表達(dá)在基因組內(nèi)、基因組間、以及不同環(huán)境下的復(fù)雜的非線性調(diào)控依賴關(guān)系。
在我校計(jì)算生物學(xué)中心主任鄔榮領(lǐng)教授創(chuàng)立的北京林業(yè)大學(xué)-賓夕法尼亞州立大學(xué)合作研究平臺(tái)上，信息學(xué)院的王建新博士在中美兩地經(jīng)過(guò)一年半時(shí)間的潛心研究，終于攻克了信息熵理論與基因表達(dá)可塑性的融合建模這一世界性難題。這一工作的責(zé)任作者、計(jì)算生物學(xué)專家鄔榮領(lǐng)教授對(duì)王建新博士刻苦鉆研、敢于挑戰(zhàn)的精神極為贊賞, 認(rèn)為這一工作為理解和研究生物與環(huán)境互作、進(jìn)而為研究不同物種之間的互作和協(xié)同進(jìn)化提供了新的有力工具。
參加該項(xiàng)工作的還有信息學(xué)院的碩士研究生陳波、美國(guó)賓夕法尼亞州立大學(xué)的博士研究生王亞群和王寧濤，美國(guó)休斯敦大學(xué)計(jì)算機(jī)系的Marc Garbey教授、美國(guó)佛羅里達(dá)大學(xué)醫(yī)學(xué)工程系的Roger Tran-Son-Tay教授和醫(yī)療系的Scott A. Berceli教授。這一研究是我校院際合作的典范, 更是我校計(jì)算生物學(xué)中心主導(dǎo)的多領(lǐng)域、跨學(xué)科國(guó)際合作的成果之一, 有力提高了我校在計(jì)算生物學(xué)領(lǐng)域的國(guó)際影響力。
論文鏈接：http://nar.oxfordjournals.org/content/early/2013/03/06/nar.gkt147.full.pdf+html
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