日前,我校林金星教授團(tuán)隊(duì)和中科院植物研究所、法國國家科研中心等單位合作,在自主搭建植物細(xì)胞單分子檢測(cè)平臺(tái)的基礎(chǔ)上,通過植物膜蛋白動(dòng)力學(xué)和寡聚化狀態(tài)定量分析,發(fā)展了適合植物單分子研究的新算法,實(shí)現(xiàn)了單個(gè)膜蛋白動(dòng)態(tài)參數(shù)的精準(zhǔn)分析。相關(guān)研究工作發(fā)表在Nature Protocols上 (影響因子為9.673)。
林金星團(tuán)隊(duì)通過自主搭建適合植物細(xì)胞膜蛋白動(dòng)態(tài)分析的單分子檢測(cè)平臺(tái),克服了細(xì)胞壁對(duì)蛋白動(dòng)態(tài)分析的干擾,建立了全內(nèi)反射熒光顯微術(shù),實(shí)現(xiàn)了對(duì)單個(gè)質(zhì)膜蛋白運(yùn)動(dòng)的實(shí)時(shí)成像,相關(guān)的研究成果曾經(jīng)發(fā)表在PNAS, Plant Cell 等著名刊物。在此基礎(chǔ)上,他們又針對(duì)多假設(shè)追蹤算法在多目標(biāo)關(guān)聯(lián)跟蹤過程中計(jì)算量大的問題,提出了一種改進(jìn)的多假設(shè)跟蹤算法。通過修改假設(shè)生成、假設(shè)刪除、新目標(biāo)初始化、交叉目標(biāo)關(guān)聯(lián),并結(jié)合植物細(xì)胞熒光成像的特點(diǎn),用MATLAB實(shí)現(xiàn)了算法,并簡化了運(yùn)算,從而提高了運(yùn)算速度,在實(shí)踐中取得了良好的應(yīng)用效果,將單個(gè)膜蛋白運(yùn)動(dòng)參數(shù)的分析精度推進(jìn)到納米和毫秒級(jí),為進(jìn)一步揭示植物細(xì)胞膜蛋白通過不同聚合方式和側(cè)向運(yùn)動(dòng)實(shí)現(xiàn)自我活性調(diào)節(jié)的機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
該研究曾經(jīng)得到國家自然科學(xué)基金和973項(xiàng)目資助,生物學(xué)院李曉娟副教授是共同第一作者。
附:文章鏈接http://www.nature.com/nprot/journal/v10/n12/full/nprot.2015.132.html
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