HCV NS5B聚合酶V494I, V494A, M426A, M423T突變導(dǎo)致Filibuvir耐藥性產(chǎn)生的機(jī)制研究
目前，分子動(dòng)力學(xué)方法是研究耐藥性產(chǎn)生機(jī)理的一種很有效可行的手段。Filibuvir是Pfizer公司于2009年發(fā)現(xiàn)的非核酸類(lèi)抑制劑，它對(duì)于HCV NS5B RNA依賴(lài)的RNA聚合酶(RdRp)表現(xiàn)出良好的抑制效果，目前處于臨床IIb研究階段。為了解釋Filibuvir耐藥性產(chǎn)生的機(jī)理，我們采用分子動(dòng)力學(xué)模擬，MM/PBSA自由能計(jì)算以及MM/GBSA自由能分解分析方法系統(tǒng)地分析了Filibuvir與野生型(WT)和突變型(V494I， V494A， M426A， M423T)NS5B RdRp(基因型為1)之間的相互作用，揭示了HCV NS5B聚合酶V494I, V494A, M426A, M423T突變導(dǎo)致Filibuvir耐藥性產(chǎn)生的機(jī)制。該工作發(fā)表在國(guó)際期刊Antiviral Research上(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0166354214003155)。
圖 WT(a)和M426A(b)體系的cartoon模型。其中，WT和M426A體系分別顯示為淡藍(lán)色和淡粉色，
重要氨基酸殘基顯示為不同顏色的棍狀模型，紅色虛線(xiàn)代表兩氨基酸殘基之間的距離。
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