我院曹東升教授課題組在Nucleic Acids Research發(fā)表研究成果
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????? 近日，我院曹東升教授團(tuán)隊(duì)與浙江大學(xué)侯廷軍教授團(tuán)隊(duì)合作，在國際權(quán)威期刊Nucleic Acids Research（IF=11.504）上發(fā)表題為“ADMETlab 2.0: an integrated online platform for accurate and comprehensive predictions of ADMET properties”的論文，推出了廣泛使用的化合物藥代動(dòng)力學(xué)和毒性預(yù)測(cè)平臺(tái)ADMETlab的全面更新版本，能夠幫助藥物化學(xué)家進(jìn)行先導(dǎo)化合物的設(shè)計(jì)與優(yōu)化。
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不理想的藥代動(dòng)力學(xué)性質(zhì)和毒性是候選藥物開發(fā)失敗的主要原因，因此應(yīng)當(dāng)盡早評(píng)估化合物的吸收、分布、代謝、排泄和毒性（ADMET）性質(zhì)。計(jì)算ADMET評(píng)估模型已經(jīng)被廣泛用于先導(dǎo)化合物的設(shè)計(jì)和優(yōu)化實(shí)踐。作為廣泛使用的ADMETlab的全面更新版本，ADMETlab 2.0支持計(jì)算的ADMET相關(guān)終點(diǎn)數(shù)目是上一版本的兩倍，包括17個(gè)基本理化性質(zhì)，13個(gè)藥物化學(xué)性質(zhì)，23個(gè)ADME性質(zhì)，27個(gè)毒性終點(diǎn)以及8個(gè)毒性團(tuán)規(guī)則（751個(gè)子結(jié)構(gòu)）。本次更新使用多任務(wù)圖注意力框架（Multi-task Graph Attention framework，MGA）進(jìn)行模型訓(xùn)練；新增添的批量計(jì)算模塊提升了計(jì)算效率；結(jié)果展示和解釋界面也作了進(jìn)一步優(yōu)化。目前ADMETlab2.0是國際上成藥性和毒性指標(biāo)評(píng)估參數(shù)最多的在線預(yù)測(cè)平臺(tái)，該工具無需注冊(cè)即可免費(fèi)使用，網(wǎng)址為：https://admetmesh.scbdd.com/?。
湘雅藥學(xué)院碩士研究生熊國麗為本文第一作者，浙江大學(xué)博士研究生吳振興和國防科技大學(xué)碩士研究生蟻佳才為共同一作。中南大學(xué)曹東升教授和浙江大學(xué)侯廷軍教授為共同通訊。上述工作得到了國家重點(diǎn)基礎(chǔ)研究計(jì)劃青年科學(xué)家項(xiàng)目，國家自然科學(xué)基金及長沙市新冠肺炎應(yīng)急項(xiàng)目的支持。
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