生物信息學(xué)實驗室蔣慶華副教授在長非編碼RNA(lncRNA)研究方面取得系列進展，相關(guān)研究成果于今年相繼發(fā)表在《BioMed Researchinternational》(IF:2.71), 《NucleicAcids Research》(IF:8.81), 《BMCgenomics》 (IF:4.04)等期刊。
長非編碼RNA(lncRNA)是一類長度大于200的非編碼RNA轉(zhuǎn)錄本，主要在表觀遺傳、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后等層面調(diào)控基因的表達。ENCODE計劃研究結(jié)果顯示人類基因組中已經(jīng)識別出15000多個lncRNA基因，但是，絕大部分lncRNA基因本身如何被轉(zhuǎn)錄調(diào)控、行使何種生物學(xué)功能以及調(diào)控哪些靶基因等問題尚未清楚。針對這些問題，蔣慶華副教授通過分析ChIP-seq數(shù)據(jù)，識別了潛在的調(diào)控~10000個lncRNA基因的轉(zhuǎn)錄因子，通過分析RNA-seq數(shù)據(jù),預(yù)測了9000個lncRNA基因的功能，通過分析lncRNA敲除前后的基因芯片及RNA-seq數(shù)據(jù)、識別了lncRNA直接或間接的靶基因，并開發(fā)了相應(yīng)的生物學(xué)數(shù)據(jù)庫及分析平臺。這些研究對于進一步認(rèn)識lncRNA具有一定的意義。
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