8月25日,The Plant Cell雜志在線發(fā)表了我校作物遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室水稻團(tuán)隊(duì)和蛋白質(zhì)科學(xué)研究團(tuán)隊(duì)的最新合作研究成果,兩個(gè)團(tuán)隊(duì)利用遺傳學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)技術(shù)闡明了CCT 家族蛋白與NF-YB、NF-YC形成三元復(fù)合物是一種普遍存在的現(xiàn)象,并且揭示了形成的CCT/NF-YB/YC三元復(fù)合物識(shí)別DNA的分子機(jī)制,研究成果以“Structural Insight into DNA Recognition by CCT/NF-YB/YC Complexes in Plant Photoperiodic Flowering”為題發(fā)表。
開(kāi)花是被子植物由營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)向生殖生長(zhǎng)轉(zhuǎn)換的中間過(guò)程,是植物一生中最重要的過(guò)程之一,在植物的發(fā)育過(guò)程中受到了嚴(yán)格的調(diào)控,植物的開(kāi)花時(shí)間也受到了光照、溫度、逆境脅迫等多種環(huán)境因素的影響,合適的開(kāi)花時(shí)間能夠讓植物繁衍得以生存,而通過(guò)對(duì)作物如水稻、玉米、小麥等開(kāi)花時(shí)間的精細(xì)控制可以得到更高的產(chǎn)量,達(dá)到高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的目的。因此,研究植物開(kāi)花是一個(gè)生物學(xué)基礎(chǔ)問(wèn)題,對(duì)于認(rèn)識(shí)植物如何響應(yīng)環(huán)境來(lái)精密調(diào)控生殖轉(zhuǎn)換和生物適應(yīng)性都有重要意義,同時(shí)也在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中具有巨大的應(yīng)用價(jià)值。
水稻的光周期響應(yīng)決定了水稻的抽穗期和地域適應(yīng)性,與水稻的最終產(chǎn)量密切相關(guān)。邢永忠教授課題組長(zhǎng)期致力于水稻產(chǎn)量形成機(jī)制的研究,在前期的研究中先后克隆了一系列調(diào)控水稻產(chǎn)量、株高和抽穗期的多效性基因Ghd7、Ghd8、Ghd7.1、Hd1/Ghd6等,它們都是水稻光周期響應(yīng)的主效基因,可以在延遲抽穗期的同時(shí)增加產(chǎn)量。其中Ghd7、Ghd7.1和Hd1分別屬于CCT家族的CMF、PRR、COL三個(gè)不同亞家族,Ghd8屬于NF-Y家族的YB亞家族,這些基因之間具有復(fù)雜的遺傳調(diào)控關(guān)系,并共同決定了水稻抽穗期的光周期響應(yīng)機(jī)制。殷平教授課題組則長(zhǎng)期致力于光信號(hào)調(diào)控復(fù)合物和核酸結(jié)合蛋白的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,在植物藍(lán)光受體的作用機(jī)制和植物PPR家族蛋白的RNA識(shí)別機(jī)制方面取得了系統(tǒng)性研究成果。
在該研究中,作者首先篩選了GHD8的互作蛋白,發(fā)現(xiàn)其可以與OsNF-YC2形成異源二聚體,接著通過(guò)熒光素酶互補(bǔ)技術(shù)、pull down技術(shù)以及凝膠阻滯技術(shù)確定了分別來(lái)自三個(gè)CCT亞家族的GHD7、GHD7.1、HD1均可以與GHD8/OsNF-YC2形成三元復(fù)合物,并且這種互作主要是通過(guò)CCT結(jié)構(gòu)域來(lái)完成的,通過(guò)EMSA和ITC分析證實(shí)了GHD7、GHD7.1、HD1與NF-YB/YC形成三元復(fù)合物后對(duì)DNA的結(jié)合能力顯著增強(qiáng)。進(jìn)一步作者解析了包裹DNA的HD1CCT/GHD8/OsNF-YC2復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)顯示CCT結(jié)構(gòu)域包含a-螺旋1、loop 1、a-螺旋2、loop 2四個(gè)二級(jí)結(jié)構(gòu)元件,前兩個(gè)元件負(fù)責(zé)與NF-YB和NF-YC互作,后兩個(gè)元件負(fù)責(zé)對(duì)DNA特異識(shí)別,NF-YB和NF-YC則通過(guò)與DNA磷酸骨架的互作來(lái)增強(qiáng)復(fù)合物對(duì)DNA的結(jié)合能力,促進(jìn)CCT蛋白對(duì)DNA的識(shí)別。作者還通過(guò)EMSA和ITC分析等生化實(shí)驗(yàn)鑒定出了CCT結(jié)構(gòu)域上多個(gè)關(guān)鍵氨基酸功能位點(diǎn),解釋了不同物種中CCT基因突變體的功能失活機(jī)制,也為利用分子育種手段改良CCT基因來(lái)培育高產(chǎn)和廣泛地域適應(yīng)性的作物品種提供了重要參考意義。
博士后申翠翠和劉海洋為本論文的共同第一作者,邢永忠教授和殷平教授為論文共同通訊作者。華中農(nóng)業(yè)大學(xué)校級(jí)蛋白質(zhì)平臺(tái)為該研究的開(kāi)展提供了支持,上海同步輻射光源(SSRF)為數(shù)據(jù)收集提供了幫助。該研究受到了科技部基金、國(guó)家自然科學(xué)基金、校自主創(chuàng)新基金和博士后基金的資助。
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文章鏈接: http://www.plantcell.org/content/early/2020/08/25/tpc.20.00067
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