?????? 近日,王連榮和陳實教授課題組與他人合作在國際著名期刊Nature Communications上發(fā)表了題為“Genomic mapping of phosphorothioates reveals partial modification of short consensus sequences”的學(xué)術(shù)論文,標(biāo)志著他們在DNA磷硫酰化修飾研究上又取得了新的進(jìn)展。
??????? 他們課題組應(yīng)用最新發(fā)展起來的單分子實時測序技術(shù),對一株海洋弧菌中的DNA磷硫酰化修飾位點進(jìn)行了基因組水平的精細(xì)定位。在基因組檢測到的21778個修飾位點中,有19005個位點分布于基因中,151個分布于tRNA中,761個分布于rRNA上,其余1861個分布于非編碼區(qū)。這項研究發(fā)現(xiàn)了一種與以往完全不一樣的修飾形式:在這種弧菌中,DNA磷硫?;揎棸l(fā)生在CCA序列模塊上,并且是特征性的DNA單鏈修飾。并發(fā)現(xiàn)DNA磷硫酰化修飾不同于以往的甲基化修飾,在基因組上的修飾是以部分修飾的狀態(tài)存在,只在約14%的CCA位點上存在修飾,而且在不同分子的同一個特定位點有時修飾有時不修飾。
??????? 在前期工作中,他們與鄧子新院士和Peter Dedon教授發(fā)現(xiàn)了DNA骨架上的磷硫?;@一新型修飾,即硫原子取代了DNA上磷酸骨架上非橋聯(lián)的氧原子,是迄今為止DNA骨架上發(fā)現(xiàn)的第一例生理修飾,又被稱為DNA上的第六元素,獲評《環(huán)球科學(xué)》2007年度十大科學(xué)進(jìn)展(2007 Global Science Top10)。王連榮和陳實教授這次聯(lián)合上海交通大學(xué)、美國麻省理工學(xué)院和美國PacBio公司通力合作又取得了這一新進(jìn)展,解決了多年來的一個科學(xué)難題,為探尋DNA磷硫酰化修飾的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ),表明他們在DNA磷硫?;揎楊I(lǐng)域取得了系統(tǒng)性的創(chuàng)新成果。王連榮教授和陳實教授為共同通訊作者,研究生陳超、熊嘯林參與了該項研究。該研究得到了國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃、國家自然科學(xué)基金等項目的支持。
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