高中山教授領銜的研究團隊完成了中國楊梅全基因組測序組裝、基因注釋,并解析了雌雄性別控制遺傳模式。近日,在國際植物生物技術知名期刊Plant Biotechnology Journal(IF=6.3)以“The red bayberry genome and genetic basis of sex determination”為題發(fā)表。浙江大學賈慧敏博士、賈惠娟教授、杭州和壹基因公司的蔡慶樂為共同第一作者,高中山教授和王軍一博士為共同通訊作者。
楊梅是我國南方重要的果樹樹種,雌雄異株,有2000多年的栽培歷史。楊梅果實營養(yǎng)豐富、風味獨特,而且具有獨特的保健功能。利用二代和三代基因組測序技術對楊梅雌、雄兩個品系的全基因組測序。楊梅基因組大小為320Mb,組裝基因組大小313 Mb,占預測基因組大小的97%,8條染色體,預測出蛋白編碼基因32493個。通過雌雄兩個自然群體混合樣重測序比較發(fā)現(xiàn)了楊梅性別控制區(qū)域在59Kb范圍內(nèi),包含性別決定候選基因,推導出性別決定模式為ZW型,雌性為雜合ZW型,雄性為純合ZZ型。開發(fā)的雌雄性別關聯(lián)分子標記可以直接應用于楊梅雜交苗的性別早期鑒定。本研究對于楊梅遺傳育種以及分子生物學研究具有重要的里程碑意義。
論文主要參加單位還有余姚林業(yè)特產(chǎn)技術推廣總站,中國農(nóng)科院作物所,中科院上海生命科學研究院逆境生物學研究中心,上海農(nóng)科院林果所,寧波農(nóng)科院林業(yè)研究所、慈溪林業(yè)技術推廣總站和荷蘭瓦赫寧根大學研究院。研究得到了國家自然科學基金項目(31471843, 31772271)以及余姚市農(nóng)林局、寧波科技項目的資助。
論文鏈接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/pbi.12985
(果樹科學研究所)
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